Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF2P15336 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF2P15336 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATF2P15336 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF2P15336 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF2P15336 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF2P15336 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF2P15336 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF2P15336 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF2P15336 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF2P15336 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF2P15336 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF2P15336 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF2P15336 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF2P15336 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF2P15336 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF2P15336 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF2P15336 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF2P15336 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF2P15336 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF2P15336 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF2P15336 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF2P15336 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF2P15336 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF2P15336 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF2P15336 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF2P15336 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF2P15336 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF2P15336 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF2P15336 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF2P15336 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF2P15336 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF2P15336 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF2P15336 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF2P15336 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF2P15336 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF2P15336 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF2P15336 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF2P15336 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF2P15336 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF2P15336 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF2P15336 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF2P15336 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF2P15336 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF2P15336 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF2P15336 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF2P15336 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF2P15336 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF2P15336 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF2P15336 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF2P15336 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF2P15336 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF2P15336 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF2P15336 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF2P15336 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF2P15336 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF2P15336 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF2P15336 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATF2P15336 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF2P15336 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF2P15336 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF2P15336 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF2P15336 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF2P15336 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF2P15336 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF2P15336 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF2P15336 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF2P15336 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF2P15336 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF2P15336 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF2P15336 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF2P15336 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF2P15336 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF2P15336 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF2P15336 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF2P15336 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF2P15336 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF2P15336 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF2P15336 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF2P15336 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF2P15336 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF2P15336 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF2P15336 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF2P15336 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF2P15336 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF2P15336 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF2P15336 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF2P15336 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF2P15336 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF2P15336 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF2P15336 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF2P15336 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF2P15336 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF2P15336 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF2P15336 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF2P15336 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF2P15336 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF2P15336 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF2P15336 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF2P15336 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms