Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARBP10826 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARBP10826 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RARBP10826 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARBP10826 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARBP10826 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RARBP10826 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RARBP10826 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARBP10826 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARBP10826 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARBP10826 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARBP10826 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RARBP10826 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RARBP10826 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARBP10826 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RARBP10826 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARBP10826 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARBP10826 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARBP10826 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARBP10826 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARBP10826 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARBP10826 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARBP10826 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARBP10826 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RARBP10826 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARBP10826 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARBP10826 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARBP10826 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARBP10826 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARBP10826 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARBP10826 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARBP10826 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARBP10826 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARBP10826 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARBP10826 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARBP10826 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RARBP10826 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARBP10826 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARBP10826 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARBP10826 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARBP10826 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARBP10826 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RARBP10826 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARBP10826 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RARBP10826 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARBP10826 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RARBP10826 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RARBP10826 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RARBP10826 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARBP10826 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARBP10826 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARBP10826 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARBP10826 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARBP10826 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARBP10826 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RARBP10826 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARBP10826 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARBP10826 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARBP10826 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARBP10826 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARBP10826 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RARBP10826 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RARBP10826 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RARBP10826 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RARBP10826 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RARBP10826 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARBP10826 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARBP10826 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARBP10826 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RARBP10826 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARBP10826 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RARBP10826 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RARBP10826 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
RARBP10826 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARBP10826 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARBP10826 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARBP10826 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARBP10826 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARBP10826 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARBP10826 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RARBP10826 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARBP10826 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARBP10826 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARBP10826 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARBP10826 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARBP10826 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARBP10826 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RARBP10826 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARBP10826 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARBP10826 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARBP10826 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RARBP10826 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARBP10826 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARBP10826 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARBP10826 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARBP10826 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARBP10826 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RARBP10826 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARBP10826 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARBP10826 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms