Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PFKMP08237 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PFKMP08237 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PFKMP08237 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PFKMP08237 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PFKMP08237 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PFKMP08237 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PFKMP08237 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PFKMP08237 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PFKMP08237 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PFKMP08237 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PFKMP08237 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PFKMP08237 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PFKMP08237 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PFKMP08237 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PFKMP08237 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PFKMP08237 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PFKMP08237 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PFKMP08237 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PFKMP08237 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PFKMP08237 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PFKMP08237 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PFKMP08237 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PFKMP08237 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PFKMP08237 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PFKMP08237 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PFKMP08237 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PFKMP08237 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PFKMP08237 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PFKMP08237 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PFKMP08237 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PFKMP08237 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKMP08237 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKMP08237 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKMP08237 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKMP08237 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKMP08237 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKMP08237 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PFKMP08237 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PFKMP08237 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PFKMP08237 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PFKMP08237 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PFKMP08237 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PFKMP08237 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PFKMP08237 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PFKMP08237 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKMP08237 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKMP08237 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKMP08237 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKMP08237 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKMP08237 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKMP08237 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKMP08237 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKMP08237 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKMP08237 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKMP08237 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PFKMP08237 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PFKMP08237 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PFKMP08237 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PFKMP08237 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PFKMP08237 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PFKMP08237 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKMP08237 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKMP08237 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKMP08237 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PFKMP08237 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PFKMP08237 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PFKMP08237 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PFKMP08237 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PFKMP08237 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKMP08237 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKMP08237 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKMP08237 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PFKMP08237 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PFKMP08237 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PFKMP08237 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFKMP08237 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFKMP08237 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFKMP08237 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFKMP08237 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PFKMP08237 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFKMP08237 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFKMP08237 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PFKMP08237 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKMP08237 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKMP08237 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKMP08237 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKMP08237 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKMP08237 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKMP08237 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKMP08237 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKMP08237 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKMP08237 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKMP08237 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKMP08237 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKMP08237 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKMP08237 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKMP08237 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKMP08237 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PFKMP08237 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms