Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYBBP04839 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYBBP04839 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYBBP04839 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYBBP04839 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYBBP04839 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYBBP04839 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYBBP04839 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CYBBP04839 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYBBP04839 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYBBP04839 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYBBP04839 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYBBP04839 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYBBP04839 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYBBP04839 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYBBP04839 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYBBP04839 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYBBP04839 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYBBP04839 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYBBP04839 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYBBP04839 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYBBP04839 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYBBP04839 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYBBP04839 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYBBP04839 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYBBP04839 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYBBP04839 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYBBP04839 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYBBP04839 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYBBP04839 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CYBBP04839 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYBBP04839 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYBBP04839 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYBBP04839 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CYBBP04839 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYBBP04839 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYBBP04839 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYBBP04839 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYBBP04839 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYBBP04839 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYBBP04839 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CYBBP04839 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYBBP04839 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYBBP04839 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYBBP04839 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYBBP04839 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYBBP04839 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYBBP04839 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYBBP04839 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYBBP04839 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYBBP04839 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYBBP04839 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYBBP04839 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYBBP04839 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYBBP04839 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYBBP04839 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CYBBP04839 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYBBP04839 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CYBBP04839 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYBBP04839 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYBBP04839 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYBBP04839 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYBBP04839 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYBBP04839 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYBBP04839 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYBBP04839 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYBBP04839 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYBBP04839 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYBBP04839 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYBBP04839 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYBBP04839 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYBBP04839 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYBBP04839 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYBBP04839 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYBBP04839 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CYBBP04839 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYBBP04839 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYBBP04839 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYBBP04839 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYBBP04839 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYBBP04839 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CYBBP04839 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYBBP04839 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYBBP04839 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYBBP04839 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYBBP04839 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYBBP04839 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYBBP04839 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYBBP04839 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYBBP04839 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYBBP04839 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYBBP04839 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYBBP04839 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYBBP04839 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYBBP04839 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYBBP04839 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYBBP04839 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYBBP04839 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYBBP04839 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYBBP04839 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms