Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP1P03956 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP1P03956 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP1P03956 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MMP1P03956 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MMP1P03956 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MMP1P03956 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MMP1P03956 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MMP1P03956 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MMP1P03956 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MMP1P03956 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MMP1P03956 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MMP1P03956 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MMP1P03956 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MMP1P03956 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP1P03956 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP1P03956 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP1P03956 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP1P03956 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP1P03956 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP1P03956 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP1P03956 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP1P03956 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP1P03956 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP1P03956 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP1P03956 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP1P03956 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP1P03956 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP1P03956 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP1P03956 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP1P03956 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP1P03956 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP1P03956 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP1P03956 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP1P03956 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP1P03956 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MMP1P03956 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MMP1P03956 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MMP1P03956 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MMP1P03956 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMP1P03956 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMP1P03956 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMP1P03956 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMP1P03956 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MMP1P03956 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MMP1P03956 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MMP1P03956 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MMP1P03956 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MMP1P03956 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MMP1P03956 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP1P03956 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP1P03956 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP1P03956 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP1P03956 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP1P03956 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP1P03956 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP1P03956 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP1P03956 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP1P03956 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP1P03956 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP1P03956 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP1P03956 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MMP1P03956 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MMP1P03956 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MMP1P03956 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MMP1P03956 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MMP1P03956 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP1P03956 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP1P03956 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MMP1P03956 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MMP1P03956 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MMP1P03956 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP1P03956 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP1P03956 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP1P03956 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP1P03956 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP1P03956 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP1P03956 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP1P03956 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP1P03956 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP1P03956 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP1P03956 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP1P03956 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP1P03956 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP1P03956 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP1P03956 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP1P03956 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP1P03956 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP1P03956 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP1P03956 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP1P03956 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP1P03956 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP1P03956 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP1P03956 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP1P03956 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP1P03956 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP1P03956 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP1P03956 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP1P03956 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP1P03956 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms