Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRBC1P01850 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRBC1P01850 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBC1P01850 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRBC1P01850 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRBC1P01850 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms