Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MT-CO1P00395 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MT-CO1P00395 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MT-CO1P00395 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MT-CO1P00395 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MT-CO1P00395 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MT-CO1P00395 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MT-CO1P00395 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MT-CO1P00395 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MT-CO1P00395 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms