Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNGR4O95473 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR4O95473 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms