Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTN5O94779 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN5O94779 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTN5O94779 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTN5O94779 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms