Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDKL5O76039 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDKL5O76039 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDKL5O76039 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDKL5O76039 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDKL5O76039 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms