Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
FLOT1O75955 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FLOT1O75955 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FLOT1O75955 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FLOT1O75955 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FLOT1O75955 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.7 ms