Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL41O60662 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL41O60662 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL41O60662 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL41O60662 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL41O60662 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms