Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN2O60636 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN2O60636 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN2O60636 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN2O60636 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN2O60636 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN2O60636 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN2O60636 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN2O60636 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN2O60636 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN2O60636 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN2O60636 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN2O60636 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN2O60636 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN2O60636 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms