Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX3O60493 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX3O60493 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX3O60493 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX3O60493 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX3O60493 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX3O60493 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX3O60493 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX3O60493 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX3O60493 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX3O60493 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX3O60493 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX3O60493 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX3O60493 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX3O60493 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX3O60493 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX3O60493 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX3O60493 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX3O60493 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX3O60493 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX3O60493 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX3O60493 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX3O60493 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX3O60493 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX3O60493 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX3O60493 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX3O60493 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX3O60493 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX3O60493 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX3O60493 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX3O60493 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX3O60493 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX3O60493 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX3O60493 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX3O60493 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX3O60493 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX3O60493 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX3O60493 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX3O60493 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX3O60493 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX3O60493 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX3O60493 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX3O60493 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX3O60493 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX3O60493 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX3O60493 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX3O60493 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX3O60493 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX3O60493 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX3O60493 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX3O60493 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX3O60493 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX3O60493 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX3O60493 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX3O60493 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX3O60493 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX3O60493 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX3O60493 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX3O60493 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX3O60493 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX3O60493 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX3O60493 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX3O60493 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX3O60493 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX3O60493 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX3O60493 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX3O60493 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX3O60493 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX3O60493 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX3O60493 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX3O60493 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX3O60493 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX3O60493 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX3O60493 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX3O60493 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX3O60493 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX3O60493 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX3O60493 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX3O60493 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX3O60493 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX3O60493 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX3O60493 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX3O60493 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX3O60493 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX3O60493 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX3O60493 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX3O60493 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX3O60493 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX3O60493 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX3O60493 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX3O60493 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX3O60493 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX3O60493 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX3O60493 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX3O60493 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX3O60493 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX3O60493 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX3O60493 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX3O60493 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX3O60493 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms