Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PPLO60437 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPLO60437 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPLO60437 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPLO60437 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPLO60437 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PPLO60437 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PPLO60437 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PPLO60437 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
PPLO60437 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPLO60437 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPLO60437 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PPLO60437 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PPLO60437 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PPLO60437 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PPLO60437 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PPLO60437 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
PPLO60437 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PPLO60437 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPLO60437 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PPLO60437 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPLO60437 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PPLO60437 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PPLO60437 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPLO60437 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPLO60437 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPLO60437 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPLO60437 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PPLO60437 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PPLO60437 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PPLO60437 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PPLO60437 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PPLO60437 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PPLO60437 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PPLO60437 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PPLO60437 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
PPLO60437 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PPLO60437 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PPLO60437 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PPLO60437 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
PPLO60437 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PPLO60437 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PPLO60437 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PPLO60437 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PPLO60437 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PPLO60437 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PPLO60437 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PPLO60437 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PPLO60437 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PPLO60437 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PPLO60437 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PPLO60437 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PPLO60437 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PPLO60437 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PPLO60437 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PPLO60437 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PPLO60437 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
PPLO60437 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PPLO60437 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PPLO60437 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PPLO60437 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PPLO60437 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPLO60437 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPLO60437 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPLO60437 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PPLO60437 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PPLO60437 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PPLO60437 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PPLO60437 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PPLO60437 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PPLO60437 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PPLO60437 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PPLO60437 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PPLO60437 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PPLO60437 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PPLO60437 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PPLO60437 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PPLO60437 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PPLO60437 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PPLO60437 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PPLO60437 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PPLO60437 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PPLO60437 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PPLO60437 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PPLO60437 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PPLO60437 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PPLO60437 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPLO60437 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPLO60437 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPLO60437 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPLO60437 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPLO60437 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PPLO60437 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PPLO60437 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PPLO60437 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PPLO60437 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PPLO60437 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PPLO60437 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
PPLO60437 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PPLO60437 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms