Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EDIL3O43854 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EDIL3O43854 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDIL3O43854 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDIL3O43854 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EDIL3O43854 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.3 ms