Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT86O43790 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT86O43790 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT86O43790 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT86O43790 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT86O43790 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT86O43790 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT86O43790 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT86O43790 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT86O43790 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT86O43790 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT86O43790 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT86O43790 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT86O43790 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT86O43790 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT86O43790 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT86O43790 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT86O43790 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT86O43790 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT86O43790 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT86O43790 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT86O43790 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT86O43790 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT86O43790 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT86O43790 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT86O43790 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT86O43790 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT86O43790 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT86O43790 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT86O43790 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT86O43790 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT86O43790 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT86O43790 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT86O43790 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT86O43790 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT86O43790 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT86O43790 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT86O43790 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT86O43790 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT86O43790 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT86O43790 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT86O43790 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT86O43790 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT86O43790 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT86O43790 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT86O43790 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT86O43790 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT86O43790 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT86O43790 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT86O43790 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT86O43790 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT86O43790 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT86O43790 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT86O43790 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT86O43790 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT86O43790 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT86O43790 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT86O43790 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT86O43790 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT86O43790 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT86O43790 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT86O43790 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT86O43790 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT86O43790 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT86O43790 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT86O43790 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT86O43790 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT86O43790 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT86O43790 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT86O43790 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT86O43790 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT86O43790 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT86O43790 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT86O43790 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT86O43790 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT86O43790 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT86O43790 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT86O43790 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT86O43790 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT86O43790 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT86O43790 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT86O43790 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT86O43790 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT86O43790 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT86O43790 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT86O43790 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT86O43790 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT86O43790 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT86O43790 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT86O43790 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT86O43790 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT86O43790 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT86O43790 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT86O43790 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT86O43790 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT86O43790 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT86O43790 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT86O43790 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT86O43790 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT86O43790 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms