Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCK2O43639 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCK2O43639 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCK2O43639 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCK2O43639 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCK2O43639 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCK2O43639 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCK2O43639 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCK2O43639 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCK2O43639 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCK2O43639 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCK2O43639 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCK2O43639 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NCK2O43639 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCK2O43639 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCK2O43639 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCK2O43639 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCK2O43639 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCK2O43639 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCK2O43639 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCK2O43639 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCK2O43639 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCK2O43639 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCK2O43639 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCK2O43639 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCK2O43639 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCK2O43639 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCK2O43639 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCK2O43639 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCK2O43639 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCK2O43639 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCK2O43639 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCK2O43639 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCK2O43639 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCK2O43639 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCK2O43639 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCK2O43639 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCK2O43639 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NCK2O43639 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCK2O43639 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCK2O43639 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCK2O43639 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCK2O43639 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.58■■■□□ 2
NCK2O43639 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NCK2O43639 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCK2O43639 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NCK2O43639 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCK2O43639 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCK2O43639 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCK2O43639 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCK2O43639 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NCK2O43639 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCK2O43639 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCK2O43639 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCK2O43639 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NCK2O43639 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCK2O43639 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCK2O43639 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NCK2O43639 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NCK2O43639 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NCK2O43639 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCK2O43639 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCK2O43639 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCK2O43639 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCK2O43639 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCK2O43639 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCK2O43639 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCK2O43639 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCK2O43639 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCK2O43639 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCK2O43639 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCK2O43639 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCK2O43639 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCK2O43639 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCK2O43639 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCK2O43639 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCK2O43639 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCK2O43639 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCK2O43639 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCK2O43639 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCK2O43639 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCK2O43639 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCK2O43639 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCK2O43639 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCK2O43639 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCK2O43639 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCK2O43639 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCK2O43639 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCK2O43639 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCK2O43639 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCK2O43639 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCK2O43639 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCK2O43639 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCK2O43639 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCK2O43639 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NCK2O43639 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCK2O43639 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCK2O43639 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCK2O43639 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCK2O43639 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms