Protein–RNA interactions for Protein: O15055

PER2, Period circadian protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER2O15055 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PER2O15055 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PER2O15055 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PER2O15055 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PER2O15055 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PER2O15055 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PER2O15055 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PER2O15055 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PER2O15055 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PER2O15055 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PER2O15055 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PER2O15055 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PER2O15055 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PER2O15055 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PER2O15055 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PER2O15055 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PER2O15055 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PER2O15055 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PER2O15055 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PER2O15055 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PER2O15055 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PER2O15055 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PER2O15055 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PER2O15055 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PER2O15055 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PER2O15055 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PER2O15055 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PER2O15055 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PER2O15055 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PER2O15055 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PER2O15055 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PER2O15055 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PER2O15055 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PER2O15055 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PER2O15055 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PER2O15055 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PER2O15055 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PER2O15055 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PER2O15055 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PER2O15055 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PER2O15055 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PER2O15055 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PER2O15055 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PER2O15055 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PER2O15055 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PER2O15055 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PER2O15055 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PER2O15055 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PER2O15055 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PER2O15055 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PER2O15055 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PER2O15055 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PER2O15055 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PER2O15055 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PER2O15055 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PER2O15055 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PER2O15055 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PER2O15055 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PER2O15055 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PER2O15055 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PER2O15055 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PER2O15055 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PER2O15055 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PER2O15055 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PER2O15055 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PER2O15055 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PER2O15055 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PER2O15055 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PER2O15055 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PER2O15055 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PER2O15055 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PER2O15055 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PER2O15055 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PER2O15055 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PER2O15055 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PER2O15055 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PER2O15055 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PER2O15055 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PER2O15055 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PER2O15055 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PER2O15055 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PER2O15055 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PER2O15055 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PER2O15055 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PER2O15055 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PER2O15055 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PER2O15055 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PER2O15055 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PER2O15055 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PER2O15055 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PER2O15055 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PER2O15055 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PER2O15055 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PER2O15055 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PER2O15055 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PER2O15055 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PER2O15055 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PER2O15055 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PER2O15055 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PER2O15055 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms