Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN4O14493 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN4O14493 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN4O14493 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN4O14493 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms