Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BNX3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3BNX3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BNX3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BNX3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BNX3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BNX3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BNX3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BNX3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BNX3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BNX3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BNX3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BNX3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNX3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNX3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BNX3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BNX3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BNX3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BNX3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BNX3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BNX3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BNX3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BNX3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BNX3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BNX3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3BNX3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
H3BNX3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
H3BNX3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BNX3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BNX3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BNX3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BNX3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BNX3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BNX3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BNX3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3BNX3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BNX3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BNX3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BNX3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BNX3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BNX3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BNX3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BNX3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BNX3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BNX3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BNX3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNX3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNX3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNX3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNX3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNX3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNX3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNX3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BNX3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BNX3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BNX3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BNX3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BNX3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BNX3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BNX3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BNX3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BNX3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BNX3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BNX3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BNX3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BNX3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BNX3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BNX3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BNX3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNX3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNX3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNX3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNX3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNX3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNX3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNX3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BNX3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BNX3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BNX3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BNX3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BNX3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BNX3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H3BNX3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BNX3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BNX3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BNX3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BNX3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BNX3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BNX3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BNX3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BNX3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BNX3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BNX3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BNX3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BNX3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BNX3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BNX3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BNX3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BNX3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BNX3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms