Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms