Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PP2D1A8MPX8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PP2D1A8MPX8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PP2D1A8MPX8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PP2D1A8MPX8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PP2D1A8MPX8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PP2D1A8MPX8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PP2D1A8MPX8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PP2D1A8MPX8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PP2D1A8MPX8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PP2D1A8MPX8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PP2D1A8MPX8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms