Protein–RNA interactions for Protein: A6NLF2

ELOA3D, Elongin-A3 member D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3DA6NLF2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ELOA3DA6NLF2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ELOA3DA6NLF2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELOA3DA6NLF2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELOA3DA6NLF2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms