Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX4

SLC22A31, Putative solute carrier family 22 member 31, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A31A6NKX4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC22A31A6NKX4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC22A31A6NKX4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A31A6NKX4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A31A6NKX4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms