Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WIPF3A6NGB9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WIPF3A6NGB9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WIPF3A6NGB9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
WIPF3A6NGB9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms