Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LINC00862A6NCI5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00862A6NCI5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00862A6NCI5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms