Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ3

LINC00854, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854A0A1B0GVQ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LINC00854A0A1B0GVQ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00854A0A1B0GVQ3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC00854A0A1B0GVQ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00854A0A1B0GVQ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms