RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeastyeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FPR4YLR449W SGS1P35187 1447 aa23.6■■□□□ 1.37
FPR4YLR449W INO80P53115 1489 aa23.3■■□□□ 1.32
FPR4YLR449W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FPR4YLR449W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
FPR4YLR449W TY1B-DR4Q07793 1604 aa22.63■■□□□ 1.21
FPR4YLR449W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
FPR4YLR449W SSN2P38931 1420 aa22.48■■□□□ 1.19
FPR4YLR449W HSL1P34244 1518 aa22.16■■□□□ 1.14
FPR4YLR449W SWR1Q05471 1514 aa22.16■■□□□ 1.14
FPR4YLR449W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
FPR4YLR449W DNA2P38859 1522 aa21.86■■□□□ 1.09
FPR4YLR449W HIR3P47171 1648 aa21.77■■□□□ 1.07
FPR4YLR449W DRS1P32892 752 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
FPR4YLR449W KOG1P38873 1557 aa21.58■■□□□ 1.05
FPR4YLR449W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
FPR4YLR449W REV3P14284 1504 aa21.29■■□□□ 1
FPR4YLR449W SIN3P22579 1536 aa21.23■□□□□ 0.99
FPR4YLR449W THO2P53552 1597 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
FPR4YLR449W BUD4P47136 1447 aa21.08■□□□□ 0.97
FPR4YLR449W SSK2P53599 1579 aa21.03■□□□□ 0.96
FPR4YLR449W ECM5Q03214 1411 aa21■□□□□ 0.95
FPR4YLR449W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
FPR4YLR449W TAF2P23255 1407 aa20.87■□□□□ 0.93
FPR4YLR449W ATG2P53855 1592 aa20.81■□□□□ 0.92
FPR4YLR449W ESP1Q03018 1630 aa20.78■□□□□ 0.92
FPR4YLR449W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
FPR4YLR449W PEP1P32319 1579 aa20.72■□□□□ 0.91
FPR4YLR449W MDS3P53094 1487 aa20.69■□□□□ 0.9
FPR4YLR449W YPK9Q12697 1472 aa20.62■□□□□ 0.89
FPR4YLR449W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
FPR4YLR449W POL1P13382 1468 aa20.48■□□□□ 0.87
FPR4YLR449W SCC2Q04002 1493 aa20.39■□□□□ 0.85
FPR4YLR449W RPO31P04051 1460 aa20.36■□□□□ 0.85
FPR4YLR449W CHD1P32657 1468 aa20.3■□□□□ 0.84
FPR4YLR449W STU1P38198 1513 aa20.27■□□□□ 0.84
FPR4YLR449W YTA7P40340 1379 aa20.21■□□□□ 0.83
FPR4YLR449W UFD4P33202 1483 aa20.21■□□□□ 0.83
FPR4YLR449W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
FPR4YLR449W YOR1P53049 1477 aa20.17■□□□□ 0.82
FPR4YLR449W RKR1Q04781 1562 aa20.15■□□□□ 0.82
FPR4YLR449W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FPR4YLR449W SMC4Q12267 1418 aa20.1■□□□□ 0.81
FPR4YLR449W MMS22Q06164 1454 aa20.08■□□□□ 0.81
FPR4YLR449W MYO4P32492 1471 aa20.01■□□□□ 0.79
FPR4YLR449W BPT1P14772 1559 aa20■□□□□ 0.79
FPR4YLR449W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa19.93■□□□□ 0.78
FPR4YLR449W TY2B-FP0CX63 1770 aa19.93■□□□□ 0.78
FPR4YLR449W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa19.93■□□□□ 0.78
FPR4YLR449W TY2B-CP25384 1770 aa19.93■□□□□ 0.78
FPR4YLR449W TY2B-DR2Q03494 1770 aa19.93■□□□□ 0.78
FPR4YLR449W TY1B-DR1Q03855 1755 aa19.93■□□□□ 0.78
FPR4YLR449W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
FPR4YLR449W TY2B-OR1Q12113 1770 aa19.93■□□□□ 0.78
FPR4YLR449W TY2B-DR1Q12472 1770 aa19.93■□□□□ 0.78
FPR4YLR449W TY2B-OR2Q12501 1770 aa19.93■□□□□ 0.78
FPR4YLR449W MTC1P47018 478 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
FPR4YLR449W TY1B-DR3Q99231 1755 aa19.82■□□□□ 0.76
FPR4YLR449W TY2B-BQ12491 1770 aa19.75■□□□□ 0.75
FPR4YLR449W SPP41P38904 1435 aa19.69■□□□□ 0.74
FPR4YLR449W TY1B-BRQ12193 1756 aa19.67■□□□□ 0.74
FPR4YLR449W TY1B-GR3Q12316 1755 aa19.67■□□□□ 0.74
FPR4YLR449W TY1B-ORQ92393 1755 aa19.67■□□□□ 0.74
FPR4YLR449W CDC25P04821 1589 aa19.67■□□□□ 0.74
FPR4YLR449W TAF7Q05021 590 aa19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-HO13535 1793 aa19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-JR1P47098 1755 aa19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-ER1Q03612 1755 aa19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-GR2Q12269 1755 aa19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-OLQ12273 1755 aa19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W PAN1P32521 1480 aa19.62■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
FPR4YLR449W TSC11P40061 1430 aa19.58■□□□□ 0.72
FPR4YLR449W STH1P32597 1359 aa19.57■□□□□ 0.72
FPR4YLR449W VTH1P40438 1549 aa19.51■□□□□ 0.71
FPR4YLR449W VTH2P40890 1549 aa19.51■□□□□ 0.71
FPR4YLR449W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
FPR4YLR449W SNT2P53127 1403 aa19.42■□□□□ 0.7
FPR4YLR449W DNF1P32660 1571 aa19.37■□□□□ 0.69
FPR4YLR449W TRM732Q03496 1420 aa19.36■□□□□ 0.69
FPR4YLR449W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
FPR4YLR449W MLP2P40457 1679 aa19.33■□□□□ 0.69
FPR4YLR449W ULS1Q08562 1619 aa19.32■□□□□ 0.68
FPR4YLR449W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
FPR4YLR449W TY1B-ER2Q03619 1755 aa19.31■□□□□ 0.68
FPR4YLR449W TY1B-MR1Q04214 1755 aa19.31■□□□□ 0.68
FPR4YLR449W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
FPR4YLR449W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
FPR4YLR449W TY1B-NL1Q12112 1755 aa19.31■□□□□ 0.68
FPR4YLR449W TY1B-GR1Q12141 1755 aa19.31■□□□□ 0.68
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