RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeastyeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC3YJL059W MTC1P47018 478 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
YHC3YJL059W DRS1P32892 752 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
YHC3YJL059W FAP1P53971 965 aa14.56□□□□□ -0.08
YHC3YJL059W PRY3P47033 881 aa13.7□□□□□ -0.22
YHC3YJL059W PRI1P10363 409 aa13.45□□□□□ -0.26
YHC3YJL059W AAD16Q02895 342 aa13.45□□□□□ -0.26
YHC3YJL059W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
YHC3YJL059W TFA1P36100 482 aa13.19□□□□□ -0.3
YHC3YJL059W ISW2Q08773 1120 aa13.09□□□□□ -0.31
YHC3YJL059W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
YHC3YJL059W YCK3P39962 524 aa12.92□□□□□ -0.34
YHC3YJL059W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
YHC3YJL059W RPG1P38249 964 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
YHC3YJL059W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
YHC3YJL059W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
YHC3YJL059W AVT3P36062 692 aa12.37□□□□□ -0.43
YHC3YJL059W TAF7Q05021 590 aa12.3□□□□□ -0.44
YHC3YJL059W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
YHC3YJL059W MRPL32P25348 183 aa12.21□□□□□ -0.45
YHC3YJL059W INO80P53115 1489 aa12.16□□□□□ -0.46
YHC3YJL059W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
YHC3YJL059W REB1P21538 810 aa11.88□□□□□ -0.51
YHC3YJL059W YGL015CP33199 130 aa11.88□□□□□ -0.51
YHC3YJL059W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
YHC3YJL059W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
YHC3YJL059W DNA2P38859 1522 aa11.51□□□□□ -0.57
YHC3YJL059W CDC27P38042 758 aa11.45□□□□□ -0.58
YHC3YJL059W DMA1P38823 416 aa11.41□□□□□ -0.58
YHC3YJL059W SPT21P35209 758 aa11.35□□□□□ -0.59
YHC3YJL059W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
YHC3YJL059W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
YHC3YJL059W LEO1P38439 464 aa11.28□□□□□ -0.6
YHC3YJL059W KOG1P38873 1557 aa11.26□□□□□ -0.61
YHC3YJL059W SWR1Q05471 1514 aa11.16□□□□□ -0.62
YHC3YJL059W MAP2P38174 421 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
YHC3YJL059W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
YHC3YJL059W TFC8Q12308 588 aa11.11□□□□□ -0.63
YHC3YJL059W HOP09932 586 aa11.03□□□□□ -0.64
YHC3YJL059W DCD1P06773 312 aa10.96□□□□□ -0.65
YHC3YJL059W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
YHC3YJL059W RIM101P33400 625 aa10.86□□□□□ -0.67
YHC3YJL059W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
YHC3YJL059W SCY1P53009 804 aa10.84□□□□□ -0.67
YHC3YJL059W PTP3P40048 928 aa10.81□□□□□ -0.68
YHC3YJL059W TGL3P40308 642 aa10.8□□□□□ -0.68
YHC3YJL059W SLX5P32828 619 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
YHC3YJL059W BCH2P36122 765 aa10.7□□□□□ -0.7
YHC3YJL059W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
YHC3YJL059W TY1B-DR4Q07793 1604 aa10.66□□□□□ -0.7
YHC3YJL059W UBP9P39967 754 aa10.64□□□□□ -0.71
YHC3YJL059W SSP1P38871 571 aa10.57□□□□□ -0.72
YHC3YJL059W LEU3P08638 886 aa10.55□□□□□ -0.72
YHC3YJL059W SIS1P25294 352 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
YHC3YJL059W MIF2P35201 549 aa10.49□□□□□ -0.73
YHC3YJL059W OXP1P28273 1286 aa10.43□□□□□ -0.74
YHC3YJL059W EPS1P40557 701 aa10.41□□□□□ -0.74
YHC3YJL059W BDF1P35817 686 aa10.38□□□□□ -0.75
YHC3YJL059W ECM5Q03214 1411 aa10.35□□□□□ -0.75
YHC3YJL059W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
YHC3YJL059W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data10.33□□□□□ -0.76not detected
YHC3YJL059W DMA2P53924 522 aa10.32□□□□□ -0.76
YHC3YJL059W AIM44Q99299 758 aa10.32□□□□□ -0.76
YHC3YJL059W MST1P07236 462 aa10.31□□□□□ -0.76
YHC3YJL059W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
YHC3YJL059W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data10.24□□□□□ -0.77not detected
YHC3YJL059W YOR238WQ08634 303 aa10.22□□□□□ -0.77
YHC3YJL059W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
YHC3YJL059W RLF2Q12495 606 aa10.2□□□□□ -0.78
YHC3YJL059W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
YHC3YJL059W RPN1P38764 993 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
YHC3YJL059W BBC1P47068 1157 aa10.18□□□□□ -0.78
YHC3YJL059W RSM7P47150 247 aa10.17□□□□□ -0.78
YHC3YJL059W YLR271WQ06152 274 aa10.16□□□□□ -0.78
YHC3YJL059W REV3P14284 1504 aa10.16□□□□□ -0.78
YHC3YJL059W BUD4P47136 1447 aa10.16□□□□□ -0.78
YHC3YJL059W HSL1P34244 1518 aa10.15□□□□□ -0.78
YHC3YJL059W YBL029C-AQ3E756 94 aa10.12□□□□□ -0.79
YHC3YJL059W MDS3P53094 1487 aa10.11□□□□□ -0.79
YHC3YJL059W THO2P53552 1597 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
YHC3YJL059W MGA2P40578 1113 aa10.1□□□□□ -0.79
YHC3YJL059W AI2P03876 854 aa10.09□□□□□ -0.79
YHC3YJL059W NAP1P25293 417 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
YHC3YJL059W YAP5P40574 245 aa10.08□□□□□ -0.8
YHC3YJL059W YFR006WP43590 535 aa10.06□□□□□ -0.8
YHC3YJL059W IFH1P39520 1085 aa10.04□□□□□ -0.8
YHC3YJL059W VNX1P42839 908 aa10.04□□□□□ -0.8
YHC3YJL059W ABP1P15891 592 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
YHC3YJL059W SGS1P35187 1447 aa9.96□□□□□ -0.82
YHC3YJL059W BPT1P14772 1559 aa9.93□□□□□ -0.82
YHC3YJL059W SPP1Q03012 353 aa9.93□□□□□ -0.82
YHC3YJL059W CKB1P43639 278 aa9.89□□□□□ -0.83
YHC3YJL059W IOC4Q04213 475 aa9.89□□□□□ -0.83
YHC3YJL059W HIR3P47171 1648 aa9.89□□□□□ -0.83
YHC3YJL059W PEP1P32319 1579 aa9.88□□□□□ -0.83
YHC3YJL059W CST9Q06032 482 aa9.88□□□□□ -0.83
YHC3YJL059W WSC3Q12215 556 aa9.87□□□□□ -0.83
YHC3YJL059W TIF11P38912 153 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
YHC3YJL059W GTT3P39996 337 aa9.85□□□□□ -0.83
YHC3YJL059W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
YHC3YJL059W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.2 ms