Protein–RNA interactions for Protein: P40557

EPS1, ER-retained PMA1-suppressing protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EPS1P40557 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.42■■□□□ 1.5
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EPS1P40557 NOP1YDL014W 984 nt23.61■■□□□ 1.37
EPS1P40557 YKL036CYKL036C 393 nt21.92■■□□□ 1.1
EPS1P40557 MDJ1YFL016C 1536 nt21.5■■□□□ 1.03
EPS1P40557 Q0297Q0297 156 nt20.73■□□□□ 0.91
EPS1P40557 SRX1YKL086W 384 nt20.68■□□□□ 0.9
EPS1P40557 YJL027CYJL027C 417 nt20.52■□□□□ 0.88
EPS1P40557 SCS3YGL126W 1143 nt20.07■□□□□ 0.8
EPS1P40557 YCR051WYCR051W 669 nt19.69■□□□□ 0.74
EPS1P40557 YOL085CYOL085C 342 nt19.03■□□□□ 0.64
EPS1P40557 DBP2YNL112W 1641 nt19.03■□□□□ 0.64
EPS1P40557 PKP1YIL042C 1185 nt18.83■□□□□ 0.6
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EPS1P40557 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.71■□□□□ 0.59
EPS1P40557 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.71■□□□□ 0.59
EPS1P40557 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.71■□□□□ 0.59
EPS1P40557 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.71■□□□□ 0.59
EPS1P40557 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.71■□□□□ 0.59
EPS1P40557 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.71■□□□□ 0.59
EPS1P40557 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.71■□□□□ 0.59
EPS1P40557 RPP1BYDL130W 321 nt18.63■□□□□ 0.57
EPS1P40557 CCC1YLR220W 969 nt18.58■□□□□ 0.56
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EPS1P40557 YBR190WYBR190W 312 nt18.16■□□□□ 0.5
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EPS1P40557 PET122YER153C 765 nt17.88■□□□□ 0.45
EPS1P40557 SCJ1YMR214W 1134 nt17.88■□□□□ 0.45
EPS1P40557 RTC3YHR087W 336 nt17.83■□□□□ 0.44
EPS1P40557 RVS167YDR388W 1449 nt17.76■□□□□ 0.43
EPS1P40557 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.73■□□□□ 0.43
EPS1P40557 SCR1SCR1 522 nt17.57■□□□□ 0.4
EPS1P40557 RRN5YLR141W 1092 nt17.34■□□□□ 0.37
EPS1P40557 SHR5YOL110W 714 nt17.2■□□□□ 0.34
EPS1P40557 YDJ1YNL064C 1230 nt17.06■□□□□ 0.32
EPS1P40557 YER088W-BYER088W-B 147 nt17■□□□□ 0.31
EPS1P40557 RSB1YOR049C 1065 nt17■□□□□ 0.31
EPS1P40557 MOT3YMR070W 1473 nt16.86■□□□□ 0.29
EPS1P40557 DEP1YAL013W 1218 nt16.82■□□□□ 0.28
EPS1P40557 GAR1YHR089C 618 nt16.79■□□□□ 0.28
EPS1P40557 VAR1Q0140 1197 nt16.74■□□□□ 0.27
EPS1P40557 URN1YPR152C 1398 nt16.74■□□□□ 0.27
EPS1P40557 Q0182Q0182 405 nt16.66■□□□□ 0.26
EPS1P40557 NME1NME1 340 nt16.64■□□□□ 0.25
EPS1P40557 PST2YDR032C 597 nt16.58■□□□□ 0.24
EPS1P40557 PUT4YOR348C 1884 nt16.52■□□□□ 0.24
EPS1P40557 YNL208WYNL208W 600 nt16.43■□□□□ 0.22
EPS1P40557 OPI9YLR338W 858 nt16.42■□□□□ 0.22
EPS1P40557 RPN10YHR200W 807 nt16.38■□□□□ 0.21
EPS1P40557 SAH1YER043C 1350 nt16.38■□□□□ 0.21
EPS1P40557 CSM2YIL132C 642 nt16.35■□□□□ 0.21
EPS1P40557 ARE1YCR048W 1833 nt16.26■□□□□ 0.19
EPS1P40557 TIR1YER011W 765 nt16.19■□□□□ 0.18
EPS1P40557 PAU21YOR394W 495 nt16.19■□□□□ 0.18
EPS1P40557 PAU22YPL282C 495 nt16.19■□□□□ 0.18
EPS1P40557 YDR509WYDR509W 348 nt16.15■□□□□ 0.18
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EPS1P40557 FIS1YIL065C 468 nt15.4■□□□□ 0.06
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EPS1P40557 HOM6YJR139C 1080 nt15.38■□□□□ 0.05
EPS1P40557 FPR4YLR449W 1179 nt15.38■□□□□ 0.05
EPS1P40557 SSA3YBL075C 1950 nt15.35■□□□□ 0.05
EPS1P40557 SEM1YDR363W-A 270 nt15.35■□□□□ 0.05
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EPS1P40557 INM2YDR287W 879 nt15.27■□□□□ 0.04
EPS1P40557 PHO4YFR034C 939 nt15.24■□□□□ 0.03
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EPS1P40557 Q0017Q0017 162 nt15.21■□□□□ 0.03
EPS1P40557 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.19■□□□□ 0.02
EPS1P40557 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt15.17■□□□□ 0.02
EPS1P40557 NPL3YDR432W 1245 nt15.16■□□□□ 0.02
EPS1P40557 RKM5YLR137W 1104 nt15.16■□□□□ 0.02
EPS1P40557 SRN2YLR119W 642 nt15.11■□□□□ 0.01
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