RNA–Protein interactions for RNA: YGR279C

SCW4, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeastyeast

Gene SCW4, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCW4YGR279C INO80P53115 1489 aa9.88□□□□□ -0.83
SCW4YGR279C SGS1P35187 1447 aa9.88□□□□□ -0.83
SCW4YGR279C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SCW4YGR279C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SCW4YGR279C TY1B-DR4Q07793 1604 aa9.6□□□□□ -0.87
SCW4YGR279C MTC1P47018 478 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SCW4YGR279C SWR1Q05471 1514 aa9.47□□□□□ -0.89
SCW4YGR279C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
SCW4YGR279C HSL1P34244 1518 aa9.33□□□□□ -0.92
SCW4YGR279C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
SCW4YGR279C KOG1P38873 1557 aa9.31□□□□□ -0.92
SCW4YGR279C DNA2P38859 1522 aa9.29□□□□□ -0.92
SCW4YGR279C DRS1P32892 752 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SCW4YGR279C SSN2P38931 1420 aa9.27□□□□□ -0.93
SCW4YGR279C HIR3P47171 1648 aa9.16□□□□□ -0.94
SCW4YGR279C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SCW4YGR279C THO2P53552 1597 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SCW4YGR279C BUD4P47136 1447 aa9□□□□□ -0.97
SCW4YGR279C ECM5Q03214 1411 aa8.97□□□□□ -0.97
SCW4YGR279C SIN3P22579 1536 aa8.92□□□□□ -0.98
SCW4YGR279C REV3P14284 1504 aa8.91□□□□□ -0.98
SCW4YGR279C MDS3P53094 1487 aa8.8□□□□□ -1
SCW4YGR279C PEP1P32319 1579 aa8.79□□□□□ -1
SCW4YGR279C SSK2P53599 1579 aa8.79□□□□□ -1
SCW4YGR279C ATG2P53855 1592 aa8.78□□□□□ -1
SCW4YGR279C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SCW4YGR279C ESP1Q03018 1630 aa8.72□□□□□ -1.01
SCW4YGR279C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SCW4YGR279C TAF2P23255 1407 aa8.7□□□□□ -1.02
SCW4YGR279C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SCW4YGR279C YPK9Q12697 1472 aa8.69□□□□□ -1.02
SCW4YGR279C RPO31P04051 1460 aa8.59□□□□□ -1.03
SCW4YGR279C SCC2Q04002 1493 aa8.57□□□□□ -1.04
SCW4YGR279C BPT1P14772 1559 aa8.56□□□□□ -1.04
SCW4YGR279C POL1P13382 1468 aa8.55□□□□□ -1.04
SCW4YGR279C UFD4P33202 1483 aa8.54□□□□□ -1.04
SCW4YGR279C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SCW4YGR279C YTA7P40340 1379 aa8.48□□□□□ -1.05
SCW4YGR279C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SCW4YGR279C SMC4Q12267 1418 aa8.46□□□□□ -1.06
SCW4YGR279C YOR1P53049 1477 aa8.43□□□□□ -1.06
SCW4YGR279C RKR1Q04781 1562 aa8.42□□□□□ -1.06
SCW4YGR279C STU1P38198 1513 aa8.41□□□□□ -1.06
SCW4YGR279C CHD1P32657 1468 aa8.39□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa8.36□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C TY2B-FP0CX63 1770 aa8.36□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa8.36□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C TY2B-CP25384 1770 aa8.36□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C TY2B-DR2Q03494 1770 aa8.36□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C TY1B-DR1Q03855 1755 aa8.36□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C TY2B-OR1Q12113 1770 aa8.36□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C TY2B-DR1Q12472 1770 aa8.36□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C TY2B-OR2Q12501 1770 aa8.36□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C MYO4P32492 1471 aa8.36□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C CDC25P04821 1589 aa8.35□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C PAN1P32521 1480 aa8.34□□□□□ -1.07
SCW4YGR279C MMS22Q06164 1454 aa8.32□□□□□ -1.08
SCW4YGR279C TAF7Q05021 590 aa8.3□□□□□ -1.08
SCW4YGR279C MET5P47169 1442 aa8.29□□□□□ -1.08
SCW4YGR279C SPP41P38904 1435 aa8.29□□□□□ -1.08
SCW4YGR279C TY1B-BRQ12193 1756 aa8.28□□□□□ -1.08
SCW4YGR279C TY1B-GR3Q12316 1755 aa8.28□□□□□ -1.08
SCW4YGR279C TY1B-ORQ92393 1755 aa8.28□□□□□ -1.08
SCW4YGR279C TY1B-DR3Q99231 1755 aa8.28□□□□□ -1.08
SCW4YGR279C TY2B-BQ12491 1770 aa8.27□□□□□ -1.08
SCW4YGR279C TY1B-HO13535 1793 aa8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-JR1P47098 1755 aa8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-ER1Q03612 1755 aa8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-GR2Q12269 1755 aa8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-OLQ12273 1755 aa8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C STH1P32597 1359 aa8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TSC11P40061 1430 aa8.25□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C FAP1P53971 965 aa8.24□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C TRM732Q03496 1420 aa8.23□□□□□ -1.09
SCW4YGR279C DNF1P32660 1571 aa8.2□□□□□ -1.1
SCW4YGR279C VTH1P40438 1549 aa8.19□□□□□ -1.1
SCW4YGR279C VTH2P40890 1549 aa8.19□□□□□ -1.1
SCW4YGR279C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SCW4YGR279C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SCW4YGR279C SNT2P53127 1403 aa8.16□□□□□ -1.1
SCW4YGR279C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
SCW4YGR279C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SCW4YGR279C TY1B-ER2Q03619 1755 aa8.12□□□□□ -1.11
SCW4YGR279C TY1B-MR1Q04214 1755 aa8.12□□□□□ -1.11
SCW4YGR279C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SCW4YGR279C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SCW4YGR279C TY1B-NL1Q12112 1755 aa8.12□□□□□ -1.11
SCW4YGR279C TY1B-GR1Q12141 1755 aa8.12□□□□□ -1.11
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