RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534206.5

ACER3-214, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene ACER3, Length 834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-214ENST00000534206 KIF27Q86VH2 1401 aa49.72■■■■■ 5.55
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ACER3-214ENST00000534206 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.42■■■■■ 5.5
ACER3-214ENST00000534206 KIF13AQ9H1H9 1805 aa49.25■■■■■ 5.47
ACER3-214ENST00000534206 ADCY10Q96PN6 1610 aa49.23■■■■■ 5.47
ACER3-214ENST00000534206 MAPKBP1O60336 1514 aa49.09■■■■■ 5.45
ACER3-214ENST00000534206 ABCC10Q5T3U5 1492 aa49.06■■■■■ 5.44
ACER3-214ENST00000534206 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP49.04■■■■■ 5.44
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ACER3-214ENST00000534206 IQGAP2Q13576 1575 aa49.01■■■■■ 5.44
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ACER3-214ENST00000534206 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.94■■■■■ 5.43
ACER3-214ENST00000534206 DIP2BQ9P265 1576 aa48.93■■■■■ 5.42
ACER3-214ENST00000534206 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.92■■■■■ 5.42
ACER3-214ENST00000534206 DISP1Q96F81 1524 aa48.89■■■■■ 5.42
ACER3-214ENST00000534206 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.83■■■■■ 5.41
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ACER3-214ENST00000534206 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.49■■■■■ 5.35
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ACER3-214ENST00000534206 ABCA8O94911 1581 aa48.21■■■■■ 5.31
ACER3-214ENST00000534206 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.19■■■■■ 5.3
ACER3-214ENST00000534206 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa48.15■■■■■ 5.3
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ACER3-214ENST00000534206 EEA1Q15075 1411 aa47.92■■■■■ 5.26
ACER3-214ENST00000534206 SAMD9Q5K651 1589 aa47.91■■■■■ 5.26
ACER3-214ENST00000534206 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.9■■■■■ 5.26
ACER3-214ENST00000534206 KCNH8Q96L42 1107 aa47.84■■■■■ 5.25
ACER3-214ENST00000534206 ATP10BO94823 1461 aa47.84■■■■■ 5.25
ACER3-214ENST00000534206 CD109Q6YHK3 1445 aa47.79■■■■■ 5.24
ACER3-214ENST00000534206 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.78■■■■■ 5.24
ACER3-214ENST00000534206 ARID3CA6NKF2 412 aa47.76■■■■■ 5.24
ACER3-214ENST00000534206 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.76■■■■■ 5.24
ACER3-214ENST00000534206 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.75■■■■■ 5.23
ACER3-214ENST00000534206 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.63■■■■■ 5.22
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ACER3-214ENST00000534206 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.4■■■■■ 5.18
ACER3-214ENST00000534206 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.36■■■■■ 5.17
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ACER3-214ENST00000534206 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
ACER3-214ENST00000534206 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.25■■■■■ 5.16
ACER3-214ENST00000534206 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.23■■■■■ 5.15
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ACER3-214ENST00000534206 RAPGEF3O95398 923 aa47.15■■■■■ 5.14
ACER3-214ENST00000534206 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.1■■■■■ 5.13
ACER3-214ENST00000534206 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
ACER3-214ENST00000534206 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP47.07■■■■■ 5.13
ACER3-214ENST00000534206 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa47.07■■■■■ 5.12
ACER3-214ENST00000534206 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.98■■■■■ 5.11
ACER3-214ENST00000534206 FMN1Q68DA7 1419 aa46.94■■■■■ 5.1
ACER3-214ENST00000534206 AKNAQ7Z591 1439 aa46.92■■■■■ 5.1
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ACER3-214ENST00000534206 KIF14Q15058 1648 aa46.65■■■■■ 5.06
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ACER3-214ENST00000534206 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.62■■■■■ 5.05
ACER3-214ENST00000534206 YEATS2Q9ULM3 1422 aa46.62■■■■■ 5.05
ACER3-214ENST00000534206 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.61■■■■■ 5.05
ACER3-214ENST00000534206 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.58■■■■■ 5.05
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ACER3-214ENST00000534206 MADDQ8WXG6 1647 aa46.56■■■■■ 5.04
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