RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 WDR97A6NE52 1622 aa41.4■■■■■ 4.22
UBP1-201ENST00000283628 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
UBP1-201ENST00000283628 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa41.27■■■■■ 4.2
UBP1-201ENST00000283628 MAP3K1Q13233 1512 aa41.26■■■■■ 4.2
UBP1-201ENST00000283628 CUL7Q14999 1698 aa41.23■■■■■ 4.19
UBP1-201ENST00000283628 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.21■■■■■ 4.19
UBP1-201ENST00000283628 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.2■■■■■ 4.19
UBP1-201ENST00000283628 MIER1Q8N108 512 aa41.15■■■■■ 4.18
UBP1-201ENST00000283628 TIAM1Q13009 1591 aa41.14■■■■■ 4.18
UBP1-201ENST00000283628 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.13■■■■■ 4.18
UBP1-201ENST00000283628 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
UBP1-201ENST00000283628 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.04■■■■■ 4.16
UBP1-201ENST00000283628 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
UBP1-201ENST00000283628 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.96■■■■■ 4.15
UBP1-201ENST00000283628 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.93■■■■■ 4.14
UBP1-201ENST00000283628 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
UBP1-201ENST00000283628 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.92■■■■■ 4.14
UBP1-201ENST00000283628 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.89■■■■■ 4.14
UBP1-201ENST00000283628 WDR62O43379 1518 aa40.89■■■■■ 4.14
UBP1-201ENST00000283628 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
UBP1-201ENST00000283628 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.78■■■■■ 4.12
UBP1-201ENST00000283628 PBRM1Q86U86 1689 aa40.78■■■■■ 4.12
UBP1-201ENST00000283628 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.78■■■■■ 4.12
UBP1-201ENST00000283628 IFT140Q96RY7 1462 aa40.73■■■■■ 4.11
UBP1-201ENST00000283628 ITGAEP38570 1179 aa40.7■■■■■ 4.11
UBP1-201ENST00000283628 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.7■■■■■ 4.11
UBP1-201ENST00000283628 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.7■■■■■ 4.11
UBP1-201ENST00000283628 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.7■■■■■ 4.11
UBP1-201ENST00000283628 MAPKBP1O60336 1514 aa40.69■■■■■ 4.1
UBP1-201ENST00000283628 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.67■■■■■ 4.14e-12■■■□□ 18.4
UBP1-201ENST00000283628 ERCC6Q03468 1493 aa40.67■■■■■ 4.1
UBP1-201ENST00000283628 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
UBP1-201ENST00000283628 GRIN2BQ13224 1484 aa40.61■■■■■ 4.09
UBP1-201ENST00000283628 ADAMTS12P58397 1594 aa40.6■■■■■ 4.09
UBP1-201ENST00000283628 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.6■■■■■ 4.09
UBP1-201ENST00000283628 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.56■■■■■ 4.08
UBP1-201ENST00000283628 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
UBP1-201ENST00000283628 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.53■■■■■ 4.085e-10■■■■□ 19.8
UBP1-201ENST00000283628 SAMD9Q5K651 1589 aa40.53■■■■■ 4.08
UBP1-201ENST00000283628 P3H3Q8IVL6 736 aa40.51■■■■■ 4.07
UBP1-201ENST00000283628 FMN1Q68DA7 1419 aa40.46■■■■■ 4.07
UBP1-201ENST00000283628 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
UBP1-201ENST00000283628 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
UBP1-201ENST00000283628 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
UBP1-201ENST00000283628 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.35■■■■■ 4.05
UBP1-201ENST00000283628 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.34■■■■■ 4.05
UBP1-201ENST00000283628 IQGAP2Q13576 1575 aa40.3■■■■■ 4.04
UBP1-201ENST00000283628 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.25■■■■■ 4.03
UBP1-201ENST00000283628 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
UBP1-201ENST00000283628 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.13■■■■■ 4.02
UBP1-201ENST00000283628 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.13■■■■■ 4.02
UBP1-201ENST00000283628 GRIN2AQ12879 1464 aa40.13■■■■■ 4.02
UBP1-201ENST00000283628 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.13■■■■■ 4.01
UBP1-201ENST00000283628 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.13■■■■■ 4.01
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.09■■■■■ 4.01
UBP1-201ENST00000283628 HFM1A2PYH4 1435 aa40.05■■■■■ 4
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UBP1-201ENST00000283628 SYNJ2O15056 1496 aa40.02■■■■■ 4
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UBP1-201ENST00000283628 NCOA2Q15596 1464 aa40.01■■■■■ 4
UBP1-201ENST00000283628 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.01■■■■■ 4
UBP1-201ENST00000283628 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40■■■■□ 3.99
UBP1-201ENST00000283628 UACAQ9BZF9 1416 aa39.97■■■■□ 3.99
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
UBP1-201ENST00000283628 PTPRKQ15262 1439 aa39.92■■■■□ 3.98
UBP1-201ENST00000283628 HECW1Q76N89 1606 aa39.91■■■■□ 3.98
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0556O60303 1618 aa39.9■■■■□ 3.98
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF11O15085 1522 aa39.9■■■■□ 3.98
UBP1-201ENST00000283628 CEP170Q5SW79 1584 aa39.89■■■■□ 3.98
UBP1-201ENST00000283628 DISP1Q96F81 1524 aa39.89■■■■□ 3.98
UBP1-201ENST00000283628 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
UBP1-201ENST00000283628 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
UBP1-201ENST00000283628 NAIPQ13075 1403 aa39.85■■■■□ 3.97
UBP1-201ENST00000283628 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
UBP1-201ENST00000283628 TONSLQ96HA7 1378 aa39.82■■■■□ 3.97
UBP1-201ENST00000283628 NUP160Q12769 1436 aa39.8■■■■□ 3.96
UBP1-201ENST00000283628 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
UBP1-201ENST00000283628 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.75■■■■□ 3.95
UBP1-201ENST00000283628 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
UBP1-201ENST00000283628 KCNH8Q96L42 1107 aa39.72■■■■□ 3.95
UBP1-201ENST00000283628 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.7■■■■□ 3.95
UBP1-201ENST00000283628 AKNAQ7Z591 1439 aa39.67■■■■□ 3.94
UBP1-201ENST00000283628 FBLN2P98095 1184 aa39.66■■■■□ 3.94
UBP1-201ENST00000283628 CCER2I3L3R5 266 aa39.65■■■■□ 3.94
UBP1-201ENST00000283628 MYT1Q01538 1121 aa39.63■■■■□ 3.93
UBP1-201ENST00000283628 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
UBP1-201ENST00000283628 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.6■■■■□ 3.93
UBP1-201ENST00000283628 MIA2Q96PC5 1412 aa39.58■■■■□ 3.93
UBP1-201ENST00000283628 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.56■■■■□ 3.92
UBP1-201ENST00000283628 ANP32CO43423 234 aa39.55■■■■□ 3.92
UBP1-201ENST00000283628 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
UBP1-201ENST00000283628 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.52■■■■□ 3.92
UBP1-201ENST00000283628 JPH4Q96JJ6 628 aa39.52■■■■□ 3.92
UBP1-201ENST00000283628 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
UBP1-201ENST00000283628 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.41■■■■□ 3.9
UBP1-201ENST00000283628 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
UBP1-201ENST00000283628 CHD1O14646 1710 aa39.39■■■■□ 3.9
UBP1-201ENST00000283628 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.36■■■■□ 3.89
UBP1-201ENST00000283628 KDM6BO15054 1643 aa39.35■■■■□ 3.89
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