RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.6□□□□□ -0.87
UBP1-201ENST00000283628 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.31□□□□□ -0.92
UBP1-201ENST00000283628 MT1GP13640 62 aa9.07□□□□□ -0.96
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa9.07□□□□□ -0.96
UBP1-201ENST00000283628 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.06□□□□□ -0.96
UBP1-201ENST00000283628 MT1MQ8N339 61 aa9.06□□□□□ -0.96
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa9.03□□□□□ -0.96
UBP1-201ENST00000283628 LOC100996750A0A140TA64 210 aa9.01□□□□□ -0.97
UBP1-201ENST00000283628 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.98□□□□□ -0.97
UBP1-201ENST00000283628 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.96□□□□□ -0.97
UBP1-201ENST00000283628 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
UBP1-201ENST00000283628 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.85□□□□□ -0.99
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP5-9P26371 169 aa8.73□□□□□ -1.01
UBP1-201ENST00000283628 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
UBP1-201ENST00000283628 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.55□□□□□ -1.04
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP12-4P60329 112 aa8.44□□□□□ -1.06
UBP1-201ENST00000283628 MDN1Q9NU22 5596 aa8.43□□□□□ -1.06
UBP1-201ENST00000283628 SPRR2EP22531 72 aa8.39□□□□□ -1.07
UBP1-201ENST00000283628 SPRR2BP35325 72 aa8.39□□□□□ -1.07
UBP1-201ENST00000283628 SPRR2AP35326 72 aa8.39□□□□□ -1.07
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.34□□□□□ -1.07
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.33□□□□□ -1.08
UBP1-201ENST00000283628 LCE3BQ5TA77 95 aa8.31□□□□□ -1.08
UBP1-201ENST00000283628 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
UBP1-201ENST00000283628 MT1AP04731 61 aa8.25□□□□□ -1.09
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa8.18□□□□□ -1.1
UBP1-201ENST00000283628 SPRR2DP22532 72 aa8.07□□□□□ -1.12
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.07□□□□□ -1.12
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
UBP1-201ENST00000283628 LCE3DQ9BYE3 92 aa7.94□□□□□ -1.14
UBP1-201ENST00000283628 LCE3EQ5T5B0 92 aa7.85□□□□□ -1.15
UBP1-201ENST00000283628 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.72□□□□□ -1.17
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.69□□□□□ -1.18
UBP1-201ENST00000283628 NEBP20929 6669 aa7.67□□□□□ -1.18
UBP1-201ENST00000283628 PRM1P04553 51 aa7.46□□□□□ -1.22
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.43□□□□□ -1.22
UBP1-201ENST00000283628 MT3P25713 68 aa7.36□□□□□ -1.23
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa7.33□□□□□ -1.24
UBP1-201ENST00000283628 LCE4AQ5TA78 99 aa7.14□□□□□ -1.27
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.05□□□□□ -1.28
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.04□□□□□ -1.28
UBP1-201ENST00000283628 MT4P47944 62 aa7□□□□□ -1.29
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.92□□□□□ -1.3
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.88□□□□□ -1.31
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.83□□□□□ -1.32
UBP1-201ENST00000283628 LCE1DQ5T752 114 aa6.81□□□□□ -1.32
UBP1-201ENST00000283628 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.75□□□□□ -1.33
UBP1-201ENST00000283628 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.72□□□□□ -1.33
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.66□□□□□ -1.34
UBP1-201ENST00000283628 LCE1EQ5T753 118 aa6.12□□□□□ -1.43
UBP1-201ENST00000283628 MUC5ACP98088 5654 aa6.07□□□□□ -1.44
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.87□□□□□ -1.47
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.84□□□□□ -1.47
UBP1-201ENST00000283628 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.82□□□□□ -1.48
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.81□□□□□ -1.48
UBP1-201ENST00000283628 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.78□□□□□ -1.48
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.75□□□□□ -1.49
UBP1-201ENST00000283628 LCE1CQ5T751 118 aa5.73□□□□□ -1.49
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP5-8O75690 187 aa5.65□□□□□ -1.5
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.57□□□□□ -1.52
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa5.32□□□□□ -1.56
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.01□□□□□ -1.61
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.94□□□□□ -1.62
UBP1-201ENST00000283628 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.92□□□□□ -1.62
UBP1-201ENST00000283628 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.76□□□□□ -1.65
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.72□□□□□ -1.65
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.65□□□□□ -1.66
UBP1-201ENST00000283628 LCE1FQ5T754 118 aa4.34□□□□□ -1.71
UBP1-201ENST00000283628 PHGR1C9JFL3 82 aa4.3□□□□□ -1.72
UBP1-201ENST00000283628 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.3□□□□□ -1.72
UBP1-201ENST00000283628 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
UBP1-201ENST00000283628 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.9□□□□□ -1.94
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms