RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.111e-15■■■■■ 44.3
UBP1-201ENST00000283628 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.046e-13■■□□□ 14.2
UBP1-201ENST00000283628 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP29.78■■■□□ 2.362e-12■■□□□ 13
UBP1-201ENST00000283628 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.242e-12■□□□□ 9.4
UBP1-201ENST00000283628 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.443e-12■■□□□ 14.2
UBP1-201ENST00000283628 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.67■■■■■ 4.14e-12■■■□□ 18.4
UBP1-201ENST00000283628 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.746e-12■■■■□ 21.3
UBP1-201ENST00000283628 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.246e-11■■■■□ 20.7
UBP1-201ENST00000283628 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.866e-11■■□□□ 12.1
UBP1-201ENST00000283628 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.312e-10■□□□□ 9.6
UBP1-201ENST00000283628 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.893e-10■□□□□ 8.7
UBP1-201ENST00000283628 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP30.5■■■□□ 2.474e-10■■□□□ 12.6
UBP1-201ENST00000283628 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.53■■■■■ 4.085e-10■■■■□ 19.8
UBP1-201ENST00000283628 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.821e-9■■□□□ 13.9
UBP1-201ENST00000283628 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.232e-9■■■■■ 43.6
UBP1-201ENST00000283628 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.014e-9■■■■■ 38.6
UBP1-201ENST00000283628 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP31.07■■■□□ 2.565e-9■■□□□ 12.4
UBP1-201ENST00000283628 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.251e-8■■■□□ 18.6
UBP1-201ENST00000283628 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.792e-8■■■■■ 27.9
UBP1-201ENST00000283628 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP32.97■■■□□ 2.872e-8■■■■□ 22
UBP1-201ENST00000283628 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP30.54■■■□□ 2.483e-8■□□□□ 10.1
UBP1-201ENST00000283628 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.231e-7■■■□□ 14.7
UBP1-201ENST00000283628 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.91e-7■■■■□ 25.2
UBP1-201ENST00000283628 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.542e-7■■■□□ 16.9
UBP1-201ENST00000283628 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP30.82■■■□□ 2.523e-7■■■■■ 36.3
UBP1-201ENST00000283628 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.343e-7■■□□□ 11.7
UBP1-201ENST00000283628 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.44■■■■□ 3.743e-7■■□□□ 12.7
UBP1-201ENST00000283628 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.813e-7■■■□□ 17.5
UBP1-201ENST00000283628 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP31.51■■■□□ 2.634e-7■□□□□ 8.7
UBP1-201ENST00000283628 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP32.05■■■□□ 2.724e-7■□□□□ 10
UBP1-201ENST00000283628 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.94e-7■□□□□ 8.7
UBP1-201ENST00000283628 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.644e-7■□□□□ 10.6
UBP1-201ENST00000283628 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.34■■■■□ 3.255e-7■■■□□ 16.3
UBP1-201ENST00000283628 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.915e-7■■■■■ 31.9
UBP1-201ENST00000283628 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.326e-7■■□□□ 11.8
UBP1-201ENST00000283628 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.59■■■■□ 3.617e-7■■■□□ 15.8
UBP1-201ENST00000283628 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP30.64■■■□□ 2.57e-7■□□□□ 9.9
UBP1-201ENST00000283628 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP32.36■■■□□ 2.778e-7■■■□□ 17.5
UBP1-201ENST00000283628 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP32.62■■■□□ 2.819e-7■■□□□ 14.1
UBP1-201ENST00000283628 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.399e-7■■■■■ 107.3
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.29■■■■□ 3.721e-6■■■■□ 26.3
UBP1-201ENST00000283628 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP33.38■■■□□ 2.931e-6■□□□□ 10.3
UBP1-201ENST00000283628 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP30.74■■■□□ 2.511e-6■■□□□ 12.5
UBP1-201ENST00000283628 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP31.34■■■□□ 2.612e-6■■□□□ 12.8
UBP1-201ENST00000283628 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.22e-6■■■■■ 47.4
UBP1-201ENST00000283628 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.372e-6■■■□□ 15.4
UBP1-201ENST00000283628 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.53e-6■□□□□ 8.7
UBP1-201ENST00000283628 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.284e-6■■■■□ 26.1
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.16e-6■■■□□ 18.9
UBP1-201ENST00000283628 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.857e-6■■■□□ 16.5
UBP1-201ENST00000283628 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP27.96■■■□□ 2.079e-6■□□□□ 11.1
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