RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000196264.4

Lmo4-207, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Lmo4, Length 1,263 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa36.01■■■■□ 3.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abcc9P70170 1546 aa35.16■■■■□ 3.22
Lmo4-207ENSMUST00000196264 NischQ80TM9 1593 aa34.93■■■■□ 3.18
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abcc8B2RUS7 1588 aa34.19■■■■□ 3.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 ScribQ80U72 1612 aa33.9■■■■□ 3.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa33.28■■■□□ 2.92
Lmo4-207ENSMUST00000196264 NacadQ5SWP3 1504 aa32.55■■■□□ 2.8
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kdm5dQ62240 1548 aa32.4■■■□□ 2.78
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Sycp2Q9CUU3 1500 aa32■■■□□ 2.71
Lmo4-207ENSMUST00000196264 BicraF8VPZ9 1578 aa31.87■■■□□ 2.69
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dnajc5P60904 198 aa31.49■■■□□ 2.63
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dcaf1Q80TR8 1506 aa31.14■■■□□ 2.57
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa31■■■□□ 2.55
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Trim41Q5NCC3 630 aa30.6■■■□□ 2.49
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ercc6F8VPZ5 1481 aa30.49■■■□□ 2.47
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fam135aQ6NS59 1506 aa30.48■■■□□ 2.47
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa30.32■■■□□ 2.45
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Smarca2Q6DIC0 1577 aa30.11■■■□□ 2.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Baz1bQ9Z277 1479 aa29.96■■■□□ 2.39
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa29.86■■■□□ 2.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Wdr62Q3U3T8 1523 aa29.83■■■□□ 2.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ubl4bQ9CQ84 188 aa29.81■■■□□ 2.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Frmpd1A2AKB4 1549 aa29.81■■■□□ 2.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Crybg2B7ZCC2 1516 aa29.8■■■□□ 2.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mrc2Q64449 1479 aa29.77■■■□□ 2.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Baz1aO88379 1555 aa29.75■■■□□ 2.35
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ccdc180J3QNE4 1664 aa29.48■■■□□ 2.31
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Unc13aQ4KUS2 1712 aa29.44■■■□□ 2.3
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa29.34■■■□□ 2.29
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa29.31■■■□□ 2.28
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Shroom2A2ALU4 1481 aa29.29■■■□□ 2.28
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Col17a1Q07563 1470 aa29.23■■■□□ 2.27
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.78■■■□□ 2.2
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Top2bQ64511 1612 aa28.73■■■□□ 2.19
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kif21aQ9QXL2 1672 aa28.73■■■□□ 2.19
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa28.68■■■□□ 2.18
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cux2P70298 1426 aa28.57■■■□□ 2.16
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
Lmo4-207ENSMUST00000196264 CftrP26361 1476 aa28.34■■■□□ 2.13
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa28.33■■■□□ 2.13
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa28.28■■■□□ 2.12
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kif15Q6P9L6 1387 aa28.25■■■□□ 2.11
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Plb1Q3TTY0 1478 aa28.2■■■□□ 2.1
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Synj1Q8CHC4 1574 aa28.16■■■□□ 2.1
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa28.03■■■□□ 2.08
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Adgrl3Q80TS3 1537 aa27.95■■■□□ 2.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cep164Q5DU05 1446 aa27.92■■■□□ 2.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rusc2Q80U22 1514 aa27.91■■■□□ 2.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Lamc3Q9R0B6 1581 aa27.84■■■□□ 2.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 PtprtQ99M80 1454 aa27.76■■■□□ 2.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Crocc2F6XLV1 1638 aa27.7■■■□□ 2.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gm156Q58A37 223 aa27.69■■■□□ 2.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 PtprkP35822 1457 aa27.68■■■□□ 2.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ift140E9PY46 1464 aa27.66■■■□□ 2.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cep170Q6A065 1588 aa27.64■■■□□ 2.01
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa27.63■■■□□ 2.01
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Il27Q8K3I6 234 aa27.56■■■□□ 2
Lmo4-207ENSMUST00000196264 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa27.51■■□□□ 1.99
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pprc1Q6NZN1 1644 aa27.43■■□□□ 1.98
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ccdc18Q640L5 1455 aa27.42■■□□□ 1.98
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Setd1bQ8CFT2 1985 aa27.36■■□□□ 1.97
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Disp1Q3TDN0 1521 aa27.31■■□□□ 1.96
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa27.26■■□□□ 1.95
Lmo4-207ENSMUST00000196264 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa27.21■■□□□ 1.95
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Camsap1A2AHC3 1581 aa27.19■■□□□ 1.94
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fgd6Q69ZL1 1399 aa27.19■■□□□ 1.94
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa27.16■■□□□ 1.94
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Golga3P55937 1487 aa27.15■■□□□ 1.94
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Chic1Q8CBW7 227 aa27.14■■□□□ 1.94
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa27.11■■□□□ 1.93
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Duox2A2AQ99 1517 aa27.11■■□□□ 1.93
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
Lmo4-207ENSMUST00000196264 TnnQ80Z71 1560 aa27.08■■□□□ 1.93
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cypt1Q8CH20 168 aa27.06■■□□□ 1.92
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abcc1O35379 1528 aa27.05■■□□□ 1.92
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rtl1Q7M732 1744 aa27.04■■□□□ 1.92
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Setbp1Q9Z180 1582 aa27.04■■□□□ 1.92
Lmo4-207ENSMUST00000196264 AknaQ80VW7 1404 aa27■■□□□ 1.91
Lmo4-207ENSMUST00000196264 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Chd1P40201 1711 aa26.93■■□□□ 1.9
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Alpk3Q924C5 1678 aa26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 726 ms