Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC83.06■■■■■ 10.89
Abcc9P70170 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC77.21■■■■■ 9.95
Abcc9P70170 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC75.57■■■■■ 9.69
Abcc9P70170 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC72.57■■■■■ 9.21
Abcc9P70170 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC72.09■■■■■ 9.13
Abcc9P70170 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC70.71■■■■■ 8.91
Abcc9P70170 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC70.21■■■■■ 8.83
Abcc9P70170 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69.81■■■■■ 8.77
Abcc9P70170 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC69.44■■■■■ 8.71
Abcc9P70170 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69.44■■■■■ 8.71
Abcc9P70170 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC69.16■■■■■ 8.66
Abcc9P70170 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.78■■■■■ 8.44
Abcc9P70170 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC67.72■■■■■ 8.43
Abcc9P70170 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.15■■■■■ 8.34
Abcc9P70170 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC67.07■■■■■ 8.33
Abcc9P70170 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC67.07■■■■■ 8.33
Abcc9P70170 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.06■■■■■ 8.33
Abcc9P70170 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.96■■■■■ 8.31
Abcc9P70170 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.88■■■■■ 8.3
Abcc9P70170 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC66.28■■■■■ 8.2
Abcc9P70170 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.04■■■■■ 8.16
Abcc9P70170 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.87■■■■■ 8.14
Abcc9P70170 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC65.74■■■■■ 8.11
Abcc9P70170 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC65.6■■■■■ 8.09
Abcc9P70170 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC65.54■■■■■ 8.08
Abcc9P70170 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC65.53■■■■■ 8.08
Abcc9P70170 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC65.11■■■■■ 8.01
Abcc9P70170 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.06■■■■■ 8.01
Abcc9P70170 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.82■■■■■ 7.97
Abcc9P70170 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.69■■■■■ 7.95
Abcc9P70170 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC64.57■■■■■ 7.93
Abcc9P70170 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC64.5■■■■■ 7.92
Abcc9P70170 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC64.48■■■■■ 7.91
Abcc9P70170 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC64.2■■■■■ 7.87
Abcc9P70170 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC64.13■■■■■ 7.86
Abcc9P70170 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC63.81■■■■■ 7.81
Abcc9P70170 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC63.72■■■■■ 7.79
Abcc9P70170 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC63.57■■■■■ 7.77
Abcc9P70170 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.41■■■■■ 7.74
Abcc9P70170 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC63.19■■■■■ 7.71
Abcc9P70170 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.18■■■■■ 7.7
Abcc9P70170 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC63.01■■■■■ 7.68
Abcc9P70170 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.9■■■■■ 7.66
Abcc9P70170 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.86■■■■■ 7.65
Abcc9P70170 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC62.77■■■■■ 7.64
Abcc9P70170 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC62.64■■■■■ 7.62
Abcc9P70170 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.52■■■■■ 7.6
Abcc9P70170 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.51■■■■■ 7.6
Abcc9P70170 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC62.5■■■■■ 7.6
Abcc9P70170 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC62.47■■■■■ 7.59
Abcc9P70170 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC62.41■■■■■ 7.58
Abcc9P70170 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC62.29■■■■■ 7.56
Abcc9P70170 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC62.24■■■■■ 7.55
Abcc9P70170 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC62.24■■■■■ 7.55
Abcc9P70170 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC62.01■■■■■ 7.52
Abcc9P70170 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC62.01■■■■■ 7.52
Abcc9P70170 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC61.92■■■■■ 7.5
Abcc9P70170 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC61.74■■■■■ 7.47
Abcc9P70170 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC61.71■■■■■ 7.47
Abcc9P70170 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC61.69■■■■■ 7.47
Abcc9P70170 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC61.67■■■■■ 7.46
Abcc9P70170 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.61■■■■■ 7.45
Abcc9P70170 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC61.52■■■■■ 7.44
Abcc9P70170 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC61.51■■■■■ 7.44
Abcc9P70170 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.44■■■■■ 7.43
Abcc9P70170 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC61.36■■■■■ 7.41
Abcc9P70170 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC61.26■■■■■ 7.4
Abcc9P70170 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.99■■■■■ 7.35
Abcc9P70170 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC60.98■■■■■ 7.35
Abcc9P70170 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC60.96■■■■■ 7.35
Abcc9P70170 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.95■■■■■ 7.35
Abcc9P70170 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC60.85■■■■■ 7.33
Abcc9P70170 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.83■■■■■ 7.33
Abcc9P70170 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.73■■■■■ 7.31
Abcc9P70170 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC60.7■■■■■ 7.31
Abcc9P70170 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC60.58■■■■■ 7.29
Abcc9P70170 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.57■■■■■ 7.29
Abcc9P70170 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.53■■■■■ 7.28
Abcc9P70170 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.49■■■■■ 7.27
Abcc9P70170 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC60.4■■■■■ 7.26
Abcc9P70170 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC60.39■■■■■ 7.26
Abcc9P70170 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC60.36■■■■■ 7.25
Abcc9P70170 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.31■■■■■ 7.24
Abcc9P70170 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC60.25■■■■■ 7.24
Abcc9P70170 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC60.16■■■■■ 7.22
Abcc9P70170 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.15■■■■■ 7.22
Abcc9P70170 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC59.97■■■■■ 7.19
Abcc9P70170 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.95■■■■■ 7.19
Abcc9P70170 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.83■■■■■ 7.17
Abcc9P70170 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.8■■■■■ 7.16
Abcc9P70170 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.79■■■■■ 7.16
Abcc9P70170 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC59.75■■■■■ 7.16
Abcc9P70170 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC59.74■■■■■ 7.15
Abcc9P70170 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC59.71■■■■■ 7.15
Abcc9P70170 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC59.65■■■■■ 7.14
Abcc9P70170 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC59.57■■■■■ 7.13
Abcc9P70170 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.49■■■■■ 7.11
Abcc9P70170 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC59.45■■■■■ 7.11
Abcc9P70170 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.44■■■■■ 7.11
Abcc9P70170 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.4■■■■■ 7.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms