Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC85.9■■■■■ 11.34
NischQ80TM9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC79.88■■■■■ 10.38
NischQ80TM9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC78.26■■■■■ 10.12
NischQ80TM9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC75.03■■■■■ 9.6
NischQ80TM9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC74.44■■■■■ 9.51
NischQ80TM9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC72.95■■■■■ 9.27
NischQ80TM9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC72.62■■■■■ 9.22
NischQ80TM9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC72.22■■■■■ 9.15
NischQ80TM9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC71.95■■■■■ 9.11
NischQ80TM9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC71.79■■■■■ 9.08
NischQ80TM9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC71.52■■■■■ 9.04
NischQ80TM9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC69.96■■■■■ 8.79
NischQ80TM9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69.72■■■■■ 8.75
NischQ80TM9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC69.4■■■■■ 8.7
NischQ80TM9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69.34■■■■■ 8.69
NischQ80TM9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC69.17■■■■■ 8.66
NischQ80TM9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69.17■■■■■ 8.66
NischQ80TM9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.87■■■■■ 8.62
NischQ80TM9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC68.55■■■■■ 8.56
NischQ80TM9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.48■■■■■ 8.55
NischQ80TM9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.35■■■■■ 8.53
NischQ80TM9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.14■■■■■ 8.5
NischQ80TM9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC68.03■■■■■ 8.48
NischQ80TM9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC67.93■■■■■ 8.46
NischQ80TM9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC67.63■■■■■ 8.42
NischQ80TM9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC67.45■■■■■ 8.39
NischQ80TM9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.15■■■■■ 8.34
NischQ80TM9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC67.12■■■■■ 8.33
NischQ80TM9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.77■■■■■ 8.28
NischQ80TM9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.76■■■■■ 8.28
NischQ80TM9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC66.75■■■■■ 8.28
NischQ80TM9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC66.51■■■■■ 8.24
NischQ80TM9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC66.49■■■■■ 8.24
NischQ80TM9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC66.36■■■■■ 8.21
NischQ80TM9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC66.15■■■■■ 8.18
NischQ80TM9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC66.03■■■■■ 8.16
NischQ80TM9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC65.87■■■■■ 8.14
NischQ80TM9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC65.75■■■■■ 8.12
NischQ80TM9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.34■■■■■ 8.05
NischQ80TM9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.3■■■■■ 8.04
NischQ80TM9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC65.26■■■■■ 8.04
NischQ80TM9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC65.08■■■■■ 8.01
NischQ80TM9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC64.96■■■■■ 7.99
NischQ80TM9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC64.81■■■■■ 7.97
NischQ80TM9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC64.78■■■■■ 7.96
NischQ80TM9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.64■■■■■ 7.94
NischQ80TM9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC64.57■■■■■ 7.93
NischQ80TM9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.53■■■■■ 7.92
NischQ80TM9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC64.41■■■■■ 7.9
NischQ80TM9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC64.33■■■■■ 7.89
NischQ80TM9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC64.32■■■■■ 7.89
NischQ80TM9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC64.3■■■■■ 7.88
NischQ80TM9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC64.12■■■■■ 7.86
NischQ80TM9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC63.93■■■■■ 7.82
NischQ80TM9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC63.78■■■■■ 7.8
NischQ80TM9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC63.78■■■■■ 7.8
NischQ80TM9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC63.76■■■■■ 7.8
NischQ80TM9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC63.73■■■■■ 7.79
NischQ80TM9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.72■■■■■ 7.79
NischQ80TM9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC63.71■■■■■ 7.79
NischQ80TM9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC63.56■■■■■ 7.77
NischQ80TM9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC63.53■■■■■ 7.76
NischQ80TM9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.52■■■■■ 7.76
NischQ80TM9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC63.52■■■■■ 7.76
NischQ80TM9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC63.41■■■■■ 7.74
NischQ80TM9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC63.36■■■■■ 7.73
NischQ80TM9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC63.21■■■■■ 7.71
NischQ80TM9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.05■■■■■ 7.68
NischQ80TM9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC62.96■■■■■ 7.67
NischQ80TM9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC62.96■■■■■ 7.67
NischQ80TM9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.92■■■■■ 7.66
NischQ80TM9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC62.85■■■■■ 7.65
NischQ80TM9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.78■■■■■ 7.64
NischQ80TM9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.61■■■■■ 7.61
NischQ80TM9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.54■■■■■ 7.6
NischQ80TM9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.52■■■■■ 7.6
NischQ80TM9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC62.5■■■■■ 7.6
NischQ80TM9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC62.48■■■■■ 7.59
NischQ80TM9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC62.39■■■■■ 7.58
NischQ80TM9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC62.38■■■■■ 7.58
NischQ80TM9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.32■■■■■ 7.57
NischQ80TM9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.24■■■■■ 7.55
NischQ80TM9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC62.16■■■■■ 7.54
NischQ80TM9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC62.15■■■■■ 7.54
NischQ80TM9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.11■■■■■ 7.53
NischQ80TM9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC61.93■■■■■ 7.51
NischQ80TM9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC61.9■■■■■ 7.5
NischQ80TM9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC61.81■■■■■ 7.49
NischQ80TM9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.8■■■■■ 7.48
NischQ80TM9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC61.73■■■■■ 7.47
NischQ80TM9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC61.66■■■■■ 7.46
NischQ80TM9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC61.62■■■■■ 7.46
NischQ80TM9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC61.62■■■■■ 7.45
NischQ80TM9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.59■■■■■ 7.45
NischQ80TM9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC61.53■■■■■ 7.44
NischQ80TM9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.52■■■■■ 7.44
NischQ80TM9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.48■■■■■ 7.43
NischQ80TM9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC61.42■■■■■ 7.42
NischQ80TM9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC61.4■■■■■ 7.42
NischQ80TM9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC61.34■■■■■ 7.41
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