Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC69.7■■■■■ 8.75
Cttnbp2B9EJA2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC64.85■■■■■ 7.97
Cttnbp2B9EJA2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.44■■■■■ 7.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC60.89■■■■■ 7.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC60.48■■■■■ 7.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC59.31■■■■■ 7.08
Cttnbp2B9EJA2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.93■■■■■ 7.02
Cttnbp2B9EJA2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.66■■■■■ 6.98
Cttnbp2B9EJA2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC58.41■■■■■ 6.94
Cttnbp2B9EJA2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.27■■■■■ 6.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC58.06■■■■■ 6.89
Cttnbp2B9EJA2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC56.73■■■■■ 6.67
Cttnbp2B9EJA2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.63■■■■■ 6.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC56.26■■■■■ 6.6
Cttnbp2B9EJA2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.22■■■■■ 6.59
Cttnbp2B9EJA2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC56.1■■■■■ 6.57
Cttnbp2B9EJA2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.08■■■■■ 6.57
Cttnbp2B9EJA2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.88■■■■■ 6.54
Cttnbp2B9EJA2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC55.57■■■■■ 6.49
Cttnbp2B9EJA2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.51■■■■■ 6.48
Cttnbp2B9EJA2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.43■■■■■ 6.46
Cttnbp2B9EJA2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.3■■■■■ 6.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC55.14■■■■■ 6.42
Cttnbp2B9EJA2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC55.13■■■■■ 6.42
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.91■■■■■ 6.38
Cttnbp2B9EJA2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.76■■■■■ 6.36
Cttnbp2B9EJA2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC54.51■■■■■ 6.32
Cttnbp2B9EJA2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.48■■■■■ 6.31
Cttnbp2B9EJA2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.24■■■■■ 6.27
Cttnbp2B9EJA2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.2■■■■■ 6.27
Cttnbp2B9EJA2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.19■■■■■ 6.26
Cttnbp2B9EJA2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.04■■■■■ 6.24
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.96■■■■■ 6.23
Cttnbp2B9EJA2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
Cttnbp2B9EJA2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC53.75■■■■■ 6.2
Cttnbp2B9EJA2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.55■■■■■ 6.16
Cttnbp2B9EJA2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC53.47■■■■■ 6.15
Cttnbp2B9EJA2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC53.35■■■■■ 6.13
Cttnbp2B9EJA2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.05■■■■■ 6.08
Cttnbp2B9EJA2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.99■■■■■ 6.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC52.88■■■■■ 6.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC52.84■■■■■ 6.05
Cttnbp2B9EJA2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC52.71■■■■■ 6.03
Cttnbp2B9EJA2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.67■■■■■ 6.02
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.57■■■■■ 6.01
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.49■■■■■ 5.99
Cttnbp2B9EJA2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.39■■■■■ 5.98
Cttnbp2B9EJA2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC52.37■■■■■ 5.97
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC52.34■■■■■ 5.97
Cttnbp2B9EJA2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC52.22■■■■■ 5.95
Cttnbp2B9EJA2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC52.2■■■■■ 5.95
Cttnbp2B9EJA2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.13■■■■■ 5.93
Cttnbp2B9EJA2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC52.04■■■■■ 5.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC51.82■■■■■ 5.89
Cttnbp2B9EJA2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
Cttnbp2B9EJA2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC51.78■■■■■ 5.88
Cttnbp2B9EJA2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
Cttnbp2B9EJA2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC51.72■■■■■ 5.87
Cttnbp2B9EJA2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC51.68■■■■■ 5.86
Cttnbp2B9EJA2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC51.61■■■■■ 5.85
Cttnbp2B9EJA2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC51.53■■■■■ 5.84
Cttnbp2B9EJA2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.51■■■■■ 5.84
Cttnbp2B9EJA2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
Cttnbp2B9EJA2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
Cttnbp2B9EJA2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC51.42■■■■■ 5.82
Cttnbp2B9EJA2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC51.3■■■■■ 5.8
Cttnbp2B9EJA2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
Cttnbp2B9EJA2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC51.16■■■■■ 5.78
Cttnbp2B9EJA2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC51.12■■■■■ 5.77
Cttnbp2B9EJA2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
Cttnbp2B9EJA2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC51■■■■■ 5.75
Cttnbp2B9EJA2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
Cttnbp2B9EJA2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.86■■■■■ 5.73
Cttnbp2B9EJA2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
Cttnbp2B9EJA2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.74■■■■■ 5.71
Cttnbp2B9EJA2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
Cttnbp2B9EJA2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC50.66■■■■■ 5.7
Cttnbp2B9EJA2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
Cttnbp2B9EJA2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
Cttnbp2B9EJA2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC50.45■■■■■ 5.67
Cttnbp2B9EJA2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.66
Cttnbp2B9EJA2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC50.4■■■■■ 5.66
Cttnbp2B9EJA2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
Cttnbp2B9EJA2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
Cttnbp2B9EJA2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC50.31■■■■■ 5.64
Cttnbp2B9EJA2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC50.17■■■■■ 5.62
Cttnbp2B9EJA2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.61
Cttnbp2B9EJA2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
Cttnbp2B9EJA2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC50.03■■■■■ 5.6
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.01■■■■■ 5.6
Cttnbp2B9EJA2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC49.99■■■■■ 5.59
Cttnbp2B9EJA2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
Cttnbp2B9EJA2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC49.93■■■■■ 5.58
Cttnbp2B9EJA2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.89■■■■■ 5.58
Cttnbp2B9EJA2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
Cttnbp2B9EJA2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
Cttnbp2B9EJA2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.82■■■■■ 5.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms