RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187004.1

Gm28626-201, mousemouse

TSL 2 BASIC

Gene Gm28626, Length 520 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa37.87■■■■□ 3.65
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Abcc9P70170 1546 aa37.12■■■■□ 3.53
Gm28626-201ENSMUST00000187004 NischQ80TM9 1593 aa36.81■■■■□ 3.48
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Abcc8B2RUS7 1588 aa36.1■■■■□ 3.37
Gm28626-201ENSMUST00000187004 ScribQ80U72 1612 aa35.72■■■■□ 3.31
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa35.29■■■■□ 3.24
Gm28626-201ENSMUST00000187004 NacadQ5SWP3 1504 aa34.35■■■■□ 3.09
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Kdm5dQ62240 1548 aa34.16■■■■□ 3.06
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Sycp2Q9CUU3 1500 aa33.79■■■■□ 3
Gm28626-201ENSMUST00000187004 BicraF8VPZ9 1578 aa33.63■■■□□ 2.97
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Dnajc5P60904 198 aa33.37■■■□□ 2.93
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Dcaf1Q80TR8 1506 aa32.84■■■□□ 2.85
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa32.65■■■□□ 2.82
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Trim41Q5NCC3 630 aa32.32■■■□□ 2.76
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Fam135aQ6NS59 1506 aa32.16■■■□□ 2.74
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Ercc6F8VPZ5 1481 aa32.12■■■□□ 2.73
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa31.9■■■□□ 2.7
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Smarca2Q6DIC0 1577 aa31.75■■■□□ 2.67
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Baz1bQ9Z277 1479 aa31.64■■■□□ 2.66
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Ubl4bQ9CQ84 188 aa31.53■■■□□ 2.64
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Frmpd1A2AKB4 1549 aa31.49■■■□□ 2.63
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Crybg2B7ZCC2 1516 aa31.48■■■□□ 2.63
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Wdr62Q3U3T8 1523 aa31.46■■■□□ 2.63
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa31.46■■■□□ 2.63
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Mrc2Q64449 1479 aa31.42■■■□□ 2.62
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Baz1aO88379 1555 aa31.33■■■□□ 2.61
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa31.01■■■□□ 2.56
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Shroom2A2ALU4 1481 aa30.95■■■□□ 2.55
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Col17a1Q07563 1470 aa30.92■■■□□ 2.54
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Ccdc180J3QNE4 1664 aa30.89■■■□□ 2.54
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Unc13aQ4KUS2 1712 aa30.81■■■□□ 2.52
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa30.8■■■□□ 2.52
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa30.38■■■□□ 2.45
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Rhox8Q6VSS7 320 aa30.33■■■□□ 2.45
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Top2bQ64511 1612 aa30.22■■■□□ 2.43
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Cux2P70298 1426 aa30.19■■■□□ 2.42
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Kif21aQ9QXL2 1672 aa30.18■■■□□ 2.42
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
Gm28626-201ENSMUST00000187004 CftrP26361 1476 aa29.94■■■□□ 2.38
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Kif15Q6P9L6 1387 aa29.84■■■□□ 2.37
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa29.79■■■□□ 2.36
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Plb1Q3TTY0 1478 aa29.79■■■□□ 2.36
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa29.76■■■□□ 2.35
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Synj1Q8CHC4 1574 aa29.66■■■□□ 2.34
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa29.55■■■□□ 2.32
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Adgrl3Q80TS3 1537 aa29.5■■■□□ 2.31
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Cep164Q5DU05 1446 aa29.46■■■□□ 2.31
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Rusc2Q80U22 1514 aa29.41■■■□□ 2.3
Gm28626-201ENSMUST00000187004 PtprtQ99M80 1454 aa29.35■■■□□ 2.29
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Lamc3Q9R0B6 1581 aa29.34■■■□□ 2.29
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Gm156Q58A37 223 aa29.32■■■□□ 2.28
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
Gm28626-201ENSMUST00000187004 PtprkP35822 1457 aa29.23■■■□□ 2.27
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Ift140E9PY46 1464 aa29.2■■■□□ 2.26
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa29.17■■■□□ 2.26
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Crocc2F6XLV1 1638 aa29.13■■■□□ 2.25
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Cep170Q6A065 1588 aa29.11■■■□□ 2.25
Gm28626-201ENSMUST00000187004 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Il27Q8K3I6 234 aa29.08■■■□□ 2.25
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa29.04■■■□□ 2.24
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Pprc1Q6NZN1 1644 aa28.94■■■□□ 2.22
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Rtl1Q7M732 1744 aa28.93■■■□□ 2.22
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Ccdc18Q640L5 1455 aa28.9■■■□□ 2.22
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Disp1Q3TDN0 1521 aa28.87■■■□□ 2.21
Gm28626-201ENSMUST00000187004 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa28.78■■■□□ 2.2
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa28.75■■■□□ 2.19
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Fgd6Q69ZL1 1399 aa28.73■■■□□ 2.19
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Cypt1Q8CH20 168 aa28.7■■■□□ 2.18
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa28.69■■■□□ 2.18
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Golga3P55937 1487 aa28.66■■■□□ 2.18
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Camsap1A2AHC3 1581 aa28.62■■■□□ 2.17
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa28.62■■■□□ 2.17
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Duox2A2AQ99 1517 aa28.61■■■□□ 2.17
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Setd1bQ8CFT2 1985 aa28.55■■■□□ 2.16
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Setbp1Q9Z180 1582 aa28.54■■■□□ 2.16
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Abcc1O35379 1528 aa28.52■■■□□ 2.16
Gm28626-201ENSMUST00000187004 TnnQ80Z71 1560 aa28.51■■■□□ 2.15
Gm28626-201ENSMUST00000187004 AknaQ80VW7 1404 aa28.47■■■□□ 2.15
Gm28626-201ENSMUST00000187004 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa28.37■■■□□ 2.13
Gm28626-201ENSMUST00000187004 Alpk3Q924C5 1678 aa28.35■■■□□ 2.13
Gm28626-201ENSMUST00000187004 CadpsQ80TJ1 1355 aa28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 90.3 ms