RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000074721.5

Hoxd8-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Myt1lP97500 1187 aa49.28■■■■■ 5.48
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Clip1Q922J3 1391 aa49.2■■■■■ 5.47
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP49.16■■■■■ 5.46
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Adamts12Q811B3 1600 aa49.03■■■■■ 5.44
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 WizO88286 1684 aaKnown RBP49■■■■■ 5.43
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa48.95■■■■■ 5.43
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Abca16E9PWJ7 1678 aa48.95■■■■■ 5.43
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cux1P53564 1515 aa48.94■■■■■ 5.42
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP48.92■■■■■ 5.42
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 PxdnQ3UQ28 1475 aa48.92■■■■■ 5.42
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 CadpsQ80TJ1 1355 aa48.84■■■■■ 5.41
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Abcc2Q8VI47 1543 aa48.83■■■■■ 5.41
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Shroom2A2ALU4 1481 aa48.82■■■■■ 5.41
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fgd6Q69ZL1 1399 aa48.8■■■■■ 5.4
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rpap1Q80TE0 1409 aa48.78■■■■■ 5.4
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ankrd26Q811D2 1581 aa48.78■■■■■ 5.4
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa48.77■■■■■ 5.4
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fyco1Q8VDC1 1437 aa48.7■■■■■ 5.39
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Abca5Q8K448 1642 aa48.66■■■■■ 5.38
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Arhgap27A2AB59 869 aa48.65■■■■■ 5.38
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Soga1E1U8D0 1418 aa48.64■■■■■ 5.38
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP48.61■■■■■ 5.37
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Map3k4O08648 1597 aa48.61■■■■■ 5.37
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Setd5Q5XJV7 1441 aa48.55■■■■■ 5.36
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Eea1Q8BL66 1411 aa48.54■■■■■ 5.36
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Erich3F6QRE9 1637 aa48.54■■■■■ 5.36
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP48.51■■■■■ 5.36
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 AknaQ80VW7 1404 aa48.5■■■■■ 5.36
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 BC005561E9Q5E2 1589 aa48.48■■■■■ 5.35
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Slx4Q6P1D7 1565 aa48.41■■■■■ 5.34
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Neo1P97798 1493 aa48.4■■■■■ 5.34
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP48.4■■■■■ 5.34
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Arap1Q4LDD4 1452 aa48.36■■■■■ 5.33
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Abcc1O35379 1528 aa48.33■■■■■ 5.33
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 WrnO09053 1401 aa48.29■■■■■ 5.32
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Pcf11G3X9Z4 1553 aa48.29■■■■■ 5.32
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa48.23■■■■■ 5.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Aebp1Q640N1 1128 aa48.22■■■■■ 5.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Chd1P40201 1711 aa48.15■■■■■ 5.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 BlmO88700 1416 aa48.14■■■■■ 5.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa48.13■■■■■ 5.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm14025A2AP89 1413 aa48.1■■■■■ 5.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Jph4Q80WT0 628 aa48.05■■■■■ 5.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa48.02■■■■■ 5.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 CntlnA2AM05 1397 aa47.94■■■■■ 5.26
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Col17a1Q07563 1470 aa47.93■■■■■ 5.26
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP47.93■■■■■ 5.26
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kif27Q7M6Z4 1394 aa47.91■■■■■ 5.26
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cep170Q6A065 1588 aa47.89■■■■■ 5.26
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP47.87■■■■■ 5.25
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tiam1Q60610 1591 aa47.85■■■■■ 5.25
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Naip1Q9QWK5 1403 aa47.84■■■■■ 5.25
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa47.84■■■■■ 5.25
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 PtprtQ99M80 1454 aa47.83■■■■■ 5.25
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa47.8■■■■■ 5.24
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Peg3Q3URU2 1571 aa47.77■■■■■ 5.24
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa47.73■■■■■ 5.23
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa47.73■■■■■ 5.23
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa47.69■■■■■ 5.22
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP47.67■■■■■ 5.22
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kdm5bQ80Y84 1544 aa47.61■■■■■ 5.21
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mroh2aD3Z750 1679 aa47.6■■■■■ 5.21
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Adgrl3Q80TS3 1537 aa47.6■■■■■ 5.21
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ncoa2Q61026 1462 aa47.59■■■■■ 5.21
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm156Q58A37 223 aa47.59■■■■■ 5.21
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lmod2Q3UHZ5 550 aa47.57■■■■■ 5.21
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Arhgef11Q68FM7 1552 aa47.56■■■■■ 5.2
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ncoa3O09000 1398 aa47.5■■■■■ 5.19
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 AI481877A2ALV5 1481 aa47.47■■■■■ 5.19
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dnajc5P60904 198 aa47.47■■■■■ 5.19
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mug1P28665 1476 aa47.44■■■■■ 5.19
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Magi1Q6RHR9 1471 aa47.44■■■■■ 5.18
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cul7Q8VE73 1689 aa47.41■■■■■ 5.18
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 NhsB1AV60 1647 aa47.39■■■■■ 5.18
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gcc2Q8CHG3 1679 aa47.37■■■■■ 5.17
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fancd2Q80V62 1450 aa47.33■■■■■ 5.17
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Igf1rQ60751 1373 aa47.32■■■■■ 5.17
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa47.29■■■■■ 5.16
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 NexmifQ5DTT1 1515 aa47.28■■■■■ 5.16
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Prex2Q3LAC4 1598 aa47.26■■■■■ 5.16
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fam163aQ8CAA5 168 aa47.24■■■■■ 5.15
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa47.24■■■■■ 5.15
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Setbp1Q9Z180 1582 aa47.23■■■■■ 5.15
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa47.22■■■■■ 5.15
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa47.21■■■■■ 5.15
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa47.2■■■■■ 5.15
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Znf608Q56A10 1511 aa47.19■■■■■ 5.15
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa47.18■■■■■ 5.14
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa47.17■■■■■ 5.14
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Pprc1Q6NZN1 1644 aa47.14■■■■■ 5.14
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Wdr7Q920I9 1489 aa47.14■■■■■ 5.14
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Atp10dQ8K2X1 1416 aa47.12■■■■■ 5.13
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ccnb3Q810T2 1396 aa47.05■■■■■ 5.12
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ak9G3UYQ4 1894 aa47.02■■■■■ 5.12
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 UbtfP25976 765 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19 ms