RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR099W-AQ3E798 87 aa-4.99□□□□□ -3.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UTP10P42945 1769 aaKnown RBP-5□□□□□ -3.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 Q0017Q9ZZX8 53 aa-5.01□□□□□ -3.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS15P22219 1454 aa-5.02□□□□□ -3.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HMRA1P0CY11 126 aa-5.03□□□□□ -3.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATP17Q06405 101 aa-5.03□□□□□ -3.21
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KOG1P38873 1557 aa-5.04□□□□□ -3.22
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP-5.05□□□□□ -3.22
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDR042CQ03205 200 aa-5.07□□□□□ -3.22
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBR200W-AQ3E755 54 aa-5.07□□□□□ -3.22
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 QCR6P00127 147 aa-5.09□□□□□ -3.22
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CSF1Q12150 2958 aa-5.09□□□□□ -3.22
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FIG2P25653 1609 aa-5.09□□□□□ -3.22
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VMA7P39111 118 aa-5.1□□□□□ -3.23
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MHF2Q3E829 80 aa-5.11□□□□□ -3.23
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PDR11P40550 1411 aa-5.13□□□□□ -3.23
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOR011W-AQ3E807 68 aa-5.14□□□□□ -3.23
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS27BP38711 82 aa-5.15□□□□□ -3.23
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP-5.15□□□□□ -3.23
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR146C-AQ8TGT9 53 aa-5.16□□□□□ -3.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PDR10P51533 1564 aa-5.16□□□□□ -3.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP-5.17□□□□□ -3.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL156W-BQ2V2P4 73 aa-5.18□□□□□ -3.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOR192C-CQ3E736 78 aa-5.18□□□□□ -3.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 POL1P13382 1468 aa-5.2□□□□□ -3.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DYN2Q02647 92 aa-5.21□□□□□ -3.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RRT15Q3E811 62 aa-5.21□□□□□ -3.24
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 WIP1Q2V2P8 89 aa-5.23□□□□□ -3.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBL039W-BP0C268 59 aa-5.24□□□□□ -3.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HAP1P0CE41 1502 aa-5.27□□□□□ -3.25
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDL022C-AP0C5L6 82 aa-5.31□□□□□ -3.26
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KSH1Q8TGJ3 72 aa-5.33□□□□□ -3.26
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPA190P10964 1664 aaKnown RBP-5.34□□□□□ -3.26
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOR105WQ08504 108 aa-5.35□□□□□ -3.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YER039C-AP0CD97 72 aa-5.36□□□□□ -3.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SUS1Q6WNK7 96 aa-5.37□□□□□ -3.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPP41P38904 1435 aa-5.38□□□□□ -3.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOR314WQ12506 109 aa-5.38□□□□□ -3.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP-5.39□□□□□ -3.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YML054C-AQ3E809 52 aa-5.39□□□□□ -3.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CHD1P32657 1468 aa-5.39□□□□□ -3.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRA1P38811 3744 aa-5.4□□□□□ -3.27
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FKS3Q04952 1785 aa-5.41□□□□□ -3.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IRA1P18963 3092 aa-5.42□□□□□ -3.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GDB1Q06625 1536 aa-5.43□□□□□ -3.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBR230W-AQ3E762 66 aa-5.46□□□□□ -3.28
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSL1P40567 111 aaPredicted RBP-5.47□□□□□ -3.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR082CQ04276 118 aa-5.47□□□□□ -3.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 THO2P53552 1597 aaKnown RBP-5.48□□□□□ -3.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SIN3P22579 1536 aa-5.51□□□□□ -3.29
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 REV3P14284 1504 aa-5.54□□□□□ -3.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IRA2P19158 3079 aa-5.55□□□□□ -3.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YKL065W-AQ2V2P2 73 aa-5.57□□□□□ -3.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GEA2P39993 1459 aaKnown RBP-5.58□□□□□ -3.3
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPI1P40092 148 aa-5.6□□□□□ -3.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOR032W-AQ8TGS1 66 aa-5.6□□□□□ -3.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SWR1Q05471 1514 aa-5.6□□□□□ -3.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DNF1P32660 1571 aa-5.63□□□□□ -3.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGL194C-AQ2V2P6 80 aa-5.64□□□□□ -3.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR105W-AQ8TGS8 64 aa-5.66□□□□□ -3.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YSP2Q06681 1438 aa-5.67□□□□□ -3.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOR304C-AO14468 76 aa-5.69□□□□□ -3.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TSC11P40061 1430 aa-5.72□□□□□ -3.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TIM12P32830 109 aa-5.72□□□□□ -3.33
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSS1P35179 80 aa-5.74□□□□□ -3.33
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS12P48589 143 aaKnown RBP-5.74□□□□□ -3.33
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL29P05747 59 aaPredicted RBP-5.75□□□□□ -3.33
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 QCR9P22289 66 aa-5.76□□□□□ -3.33
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HUB1Q6Q546 73 aa-5.77□□□□□ -3.33
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PAU7P39545 55 aa-5.8□□□□□ -3.34
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR145C-AQ2V2P0 78 aa-5.8□□□□□ -3.34
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDR034C-AP0C289 58 aa-5.81□□□□□ -3.34
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR035W-AQ45U48 73 aa-5.81□□□□□ -3.34
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR121W-AQ3E816 71 aa-5.82□□□□□ -3.34
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR175W-AQ3E766 64 aa-5.83□□□□□ -3.34
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP-5.86□□□□□ -3.35
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCL001W-BQ96VH2 84 aa-5.87□□□□□ -3.35
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MDS3P53094 1487 aa-5.92□□□□□ -3.36
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SWM2P40342 146 aa-5.93□□□□□ -3.36
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PDR12Q02785 1511 aa-5.94□□□□□ -3.36
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YER137CP40083 148 aaKnown RBP-5.99□□□□□ -3.37
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MMS22Q06164 1454 aa-5.99□□□□□ -3.37
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1B-DR4Q07793 1604 aa-6□□□□□ -3.37
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR157W-DP0CE99 70 aa-6.01□□□□□ -3.37
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOR093CQ12275 1648 aa-6.01□□□□□ -3.37
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP-6.03□□□□□ -3.37
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOR316C-AQ3E806 69 aa-6.05□□□□□ -3.38
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DNF2Q12675 1612 aa-6.07□□□□□ -3.38
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP-6.07□□□□□ -3.38
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP-6.07□□□□□ -3.38
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP-6.07□□□□□ -3.38
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FLO1P32768 1537 aa-6.09□□□□□ -3.38
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARO1P08566 1588 aaKnown RBP-6.1□□□□□ -3.39
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP-6.11□□□□□ -3.39
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ESP1Q03018 1630 aa-6.13□□□□□ -3.39
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPO31P04051 1460 aa-6.2□□□□□ -3.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERI1P62651 68 aaKnown RBP-6.2□□□□□ -3.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IQG1Q12280 1495 aa-6.21□□□□□ -3.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CWP2P43497 92 aa-6.21□□□□□ -3.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YHR073W-AP0C5N7 58 aa-6.22□□□□□ -3.41
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.4 ms