Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q547

NOP10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit NOP10, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP10Q6Q547 NSR1YGR159C 1245 nt11.83□□□□□ -0.52
NOP10Q6Q547 YML009W-BYML009W-B 477 nt11.19□□□□□ -0.62
NOP10Q6Q547 MDJ1YFL016C 1536 nt11.15□□□□□ -0.62
NOP10Q6Q547 SSA3YBL075C 1950 nt10.7□□□□□ -0.7
NOP10Q6Q547 NOP1YDL014W 984 nt10.62□□□□□ -0.71
NOP10Q6Q547 YJL027CYJL027C 417 nt10.24□□□□□ -0.77
NOP10Q6Q547 YBR190WYBR190W 312 nt9.75□□□□□ -0.85
NOP10Q6Q547 DBP2YNL112W 1641 nt9.6□□□□□ -0.87
NOP10Q6Q547 RTC3YHR087W 336 nt9.45□□□□□ -0.9
NOP10Q6Q547 PUT4YOR348C 1884 nt9.43□□□□□ -0.9
NOP10Q6Q547 SRX1YKL086W 384 nt9.27□□□□□ -0.93
NOP10Q6Q547 SSA4YER103W 1929 nt9.24□□□□□ -0.93
NOP10Q6Q547 SPT5YML010W 3192 nt9.23□□□□□ -0.93
NOP10Q6Q547 YKL036CYKL036C 393 nt9.08□□□□□ -0.96
NOP10Q6Q547 Q0297Q0297 156 nt9.06□□□□□ -0.96
NOP10Q6Q547 POA1YBR022W 534 nt9.05□□□□□ -0.96
NOP10Q6Q547 ARE1YCR048W 1833 nt9.02□□□□□ -0.97
NOP10Q6Q547 BDF1YLR399C 2061 nt9□□□□□ -0.97
NOP10Q6Q547 BSC6YOL137W 1494 nt9□□□□□ -0.97
NOP10Q6Q547 PAC11YDR488C 1602 nt8.98□□□□□ -0.97
NOP10Q6Q547 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt8.88□□□□□ -0.99
NOP10Q6Q547 RVS167YDR388W 1449 nt8.85□□□□□ -0.99
NOP10Q6Q547 TAT1YBR069C 1860 nt8.85□□□□□ -0.99
NOP10Q6Q547 NVJ2YPR091C 2313 nt8.85□□□□□ -0.99
NOP10Q6Q547 TRN1tP(UGG)A 72 nt8.82□□□□□ -1
NOP10Q6Q547 SUF9tP(UGG)F 72 nt8.82□□□□□ -1
NOP10Q6Q547 SUF8tP(UGG)H 72 nt8.82□□□□□ -1
NOP10Q6Q547 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt8.82□□□□□ -1
NOP10Q6Q547 SUF7tP(UGG)M 72 nt8.82□□□□□ -1
NOP10Q6Q547 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt8.82□□□□□ -1
NOP10Q6Q547 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt8.82□□□□□ -1
NOP10Q6Q547 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt8.82□□□□□ -1
NOP10Q6Q547 SUF11tP(UGG)O2 72 nt8.82□□□□□ -1
NOP10Q6Q547 SAH1YER043C 1350 nt8.75□□□□□ -1.01
NOP10Q6Q547 URN1YPR152C 1398 nt8.72□□□□□ -1.01
NOP10Q6Q547 YCR051WYCR051W 669 nt8.7□□□□□ -1.02
NOP10Q6Q547 CCC1YLR220W 969 nt8.69□□□□□ -1.02
NOP10Q6Q547 OPI9YLR338W 858 nt8.63□□□□□ -1.03
NOP10Q6Q547 SCJ1YMR214W 1134 nt8.63□□□□□ -1.03
NOP10Q6Q547 BUD23YCR047C 828 nt8.6□□□□□ -1.03
NOP10Q6Q547 MEP2YNL142W 1500 nt8.55□□□□□ -1.04
NOP10Q6Q547 FPS1YLL043W 2010 nt8.47□□□□□ -1.05
NOP10Q6Q547 NAB2YGL122C 1578 nt8.4□□□□□ -1.06
NOP10Q6Q547 PTC2YER089C 1395 nt8.39□□□□□ -1.07
NOP10Q6Q547 YBR220CYBR220C 1683 nt8.38□□□□□ -1.07
NOP10Q6Q547 DCW1YKL046C 1350 nt8.37□□□□□ -1.07
NOP10Q6Q547 PUN1YLR414C 792 nt8.37□□□□□ -1.07
NOP10Q6Q547 SHR5YOL110W 714 nt8.37□□□□□ -1.07
NOP10Q6Q547 DEP1YAL013W 1218 nt8.34□□□□□ -1.07
NOP10Q6Q547 RPN10YHR200W 807 nt8.29□□□□□ -1.08
NOP10Q6Q547 PCH2YBR186W 1695 nt8.28□□□□□ -1.08
NOP10Q6Q547 YMR090WYMR090W 684 nt8.27□□□□□ -1.09
NOP10Q6Q547 GUT2YIL155C 1950 nt8.27□□□□□ -1.09
NOP10Q6Q547 EMI2YDR516C 1503 nt8.25□□□□□ -1.09
NOP10Q6Q547 UME6YDR207C 2511 nt8.2□□□□□ -1.1
NOP10Q6Q547 SEC11YIR022W 504 nt8.2□□□□□ -1.1
NOP10Q6Q547 FIS1YIL065C 468 nt8.19□□□□□ -1.1
NOP10Q6Q547 YOL085CYOL085C 342 nt8.19□□□□□ -1.1
NOP10Q6Q547 YPS1YLR120C 1710 nt8.19□□□□□ -1.1
NOP10Q6Q547 SDH1YKL148C 1923 nt8.19□□□□□ -1.1
NOP10Q6Q547 YNL208WYNL208W 600 nt8.17□□□□□ -1.1
NOP10Q6Q547 YJR018WYJR018W 363 nt8.15□□□□□ -1.1
NOP10Q6Q547 PIB2YGL023C 1908 nt8.13□□□□□ -1.11
NOP10Q6Q547 DAL1YIR027C 1383 nt8.13□□□□□ -1.11
NOP10Q6Q547 YDL221WYDL221W 552 nt8.13□□□□□ -1.11
NOP10Q6Q547 YJL225CYJL225C 5277 nt8.12□□□□□ -1.11
NOP10Q6Q547 RPP1BYDL130W 321 nt8.11□□□□□ -1.11
NOP10Q6Q547 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt8.11□□□□□ -1.11
NOP10Q6Q547 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NOP10Q6Q547 PHO4YFR034C 939 nt8.06□□□□□ -1.12
NOP10Q6Q547 FPR4YLR449W 1179 nt8.06□□□□□ -1.12
NOP10Q6Q547 SSA1YAL005C 1929 nt8.03□□□□□ -1.12
NOP10Q6Q547 BOR1YNL275W 1731 nt8.01□□□□□ -1.13
NOP10Q6Q547 SCC4YER147C 1875 nt8.01□□□□□ -1.13
NOP10Q6Q547 YDR095CYDR095C 411 nt8.01□□□□□ -1.13
NOP10Q6Q547 RTF1YGL244W 1677 nt7.98□□□□□ -1.13
NOP10Q6Q547 CAC2YML102W 1407 nt7.98□□□□□ -1.13
NOP10Q6Q547 INM2YDR287W 879 nt7.98□□□□□ -1.13
NOP10Q6Q547 PTP1YDL230W 1008 nt7.92□□□□□ -1.14
NOP10Q6Q547 YSC84YHR016C 1407 nt7.91□□□□□ -1.14
NOP10Q6Q547 PTK1YKL198C 1989 nt7.9□□□□□ -1.15
NOP10Q6Q547 SCS3YGL126W 1143 nt7.87□□□□□ -1.15
NOP10Q6Q547 YJR120WYJR120W 351 nt7.87□□□□□ -1.15
NOP10Q6Q547 BOP3YNL042W 1191 nt7.87□□□□□ -1.15
NOP10Q6Q547 IRC15YPL017C 1500 nt7.87□□□□□ -1.15
NOP10Q6Q547 YHL050CYHL050C 2094 nt7.87□□□□□ -1.15
NOP10Q6Q547 RPP2AYOL039W 321 nt7.86□□□□□ -1.15
NOP10Q6Q547 YDJ1YNL064C 1230 nt7.85□□□□□ -1.15
NOP10Q6Q547 MCH5YOR306C 1566 nt7.84□□□□□ -1.15
NOP10Q6Q547 GIS3YLR094C 1509 nt7.84□□□□□ -1.15
NOP10Q6Q547 PKP1YIL042C 1185 nt7.83□□□□□ -1.16
NOP10Q6Q547 PET122YER153C 765 nt7.82□□□□□ -1.16
NOP10Q6Q547 RPP2BYDR382W 333 nt7.78□□□□□ -1.16
NOP10Q6Q547 RDN37-1RDN37-1 5354 nt7.77□□□□□ -1.17
NOP10Q6Q547 RDN37-2RDN37-2 5354 nt7.77□□□□□ -1.17
NOP10Q6Q547 GAR1YHR089C 618 nt7.76□□□□□ -1.17
NOP10Q6Q547 YBL100CYBL100C 315 nt7.75□□□□□ -1.17
NOP10Q6Q547 ALG12YNR030W 1656 nt7.74□□□□□ -1.17
NOP10Q6Q547 RRT12YCR045C 1476 nt7.71□□□□□ -1.18
NOP10Q6Q547 SPT8YLR055C 1809 nt7.67□□□□□ -1.18
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