Protein–RNA interactions for Protein: Q02785

PDR12, ATP-dependent permease PDR12, yeastyeast

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR12Q02785 YML009W-BYML009W-B 477 nt31.51■■■□□ 2.63
PDR12Q02785 NOP1YDL014W 984 nt30.47■■■□□ 2.47
PDR12Q02785 NSR1YGR159C 1245 nt30.15■■■□□ 2.42
PDR12Q02785 YKL036CYKL036C 393 nt29■■■□□ 2.23
PDR12Q02785 YJL027CYJL027C 417 nt27.27■■□□□ 1.96
PDR12Q02785 Q0297Q0297 156 nt26.95■■□□□ 1.91
PDR12Q02785 SCS3YGL126W 1143 nt26.94■■□□□ 1.9
PDR12Q02785 SRX1YKL086W 384 nt26.77■■□□□ 1.88
PDR12Q02785 MDJ1YFL016C 1536 nt26.6■■□□□ 1.85
PDR12Q02785 YCR051WYCR051W 669 nt25.65■■□□□ 1.7
PDR12Q02785 YOL085CYOL085C 342 nt25.02■■□□□ 1.6
PDR12Q02785 PKP1YIL042C 1185 nt24.88■■□□□ 1.57
PDR12Q02785 SCJ1YMR214W 1134 nt24.36■■□□□ 1.49
PDR12Q02785 RPP1BYDL130W 321 nt24.24■■□□□ 1.47
PDR12Q02785 ATS1YAL020C 1002 nt24.09■■□□□ 1.45
PDR12Q02785 TRN1tP(UGG)A 72 nt23.87■■□□□ 1.41
PDR12Q02785 SUF9tP(UGG)F 72 nt23.87■■□□□ 1.41
PDR12Q02785 SUF8tP(UGG)H 72 nt23.87■■□□□ 1.41
PDR12Q02785 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt23.87■■□□□ 1.41
PDR12Q02785 SUF7tP(UGG)M 72 nt23.87■■□□□ 1.41
PDR12Q02785 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt23.87■■□□□ 1.41
PDR12Q02785 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt23.87■■□□□ 1.41
PDR12Q02785 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt23.87■■□□□ 1.41
PDR12Q02785 SUF11tP(UGG)O2 72 nt23.87■■□□□ 1.41
PDR12Q02785 CCC1YLR220W 969 nt23.74■■□□□ 1.39
PDR12Q02785 DBP2YNL112W 1641 nt23.62■■□□□ 1.37
PDR12Q02785 PET122YER153C 765 nt23.3■■□□□ 1.32
PDR12Q02785 SCR1SCR1 522 nt23.08■■□□□ 1.29
PDR12Q02785 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt22.77■■□□□ 1.24
PDR12Q02785 RTC3YHR087W 336 nt22.54■■□□□ 1.2
PDR12Q02785 RRN5YLR141W 1092 nt22.54■■□□□ 1.2
PDR12Q02785 RSB1YOR049C 1065 nt22.48■■□□□ 1.19
PDR12Q02785 RVS167YDR388W 1449 nt22.33■■□□□ 1.17
PDR12Q02785 YER088W-BYER088W-B 147 nt22.11■■□□□ 1.13
PDR12Q02785 PST2YDR032C 597 nt22.1■■□□□ 1.13
PDR12Q02785 YBR190WYBR190W 312 nt22.08■■□□□ 1.13
PDR12Q02785 YKL097CYKL097C 411 nt21.84■■□□□ 1.09
PDR12Q02785 YDJ1YNL064C 1230 nt21.84■■□□□ 1.09
PDR12Q02785 SHR5YOL110W 714 nt21.73■■□□□ 1.07
PDR12Q02785 GAR1YHR089C 618 nt21.51■■□□□ 1.03
PDR12Q02785 SHU1YHL006C 453 nt21.26■□□□□ 0.99
PDR12Q02785 DEP1YAL013W 1218 nt21.15■□□□□ 0.98
PDR12Q02785 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt20.85■□□□□ 0.93
PDR12Q02785 YOR139CYOR139C 393 nt20.84■□□□□ 0.93
PDR12Q02785 URN1YPR152C 1398 nt20.79■□□□□ 0.92
PDR12Q02785 TIR1YER011W 765 nt20.67■□□□□ 0.9
PDR12Q02785 YNL208WYNL208W 600 nt20.56■□□□□ 0.88
PDR12Q02785 NPL3YDR432W 1245 nt20.52■□□□□ 0.87
PDR12Q02785 RPN10YHR200W 807 nt20.48■□□□□ 0.87
PDR12Q02785 MNP1YGL068W 585 nt20.32■□□□□ 0.84
PDR12Q02785 SRB2YHR041C 633 nt20.32■□□□□ 0.84
PDR12Q02785 SSA1YAL005C 1929 nt20.31■□□□□ 0.84
PDR12Q02785 OPI9YLR338W 858 nt20.13■□□□□ 0.81
PDR12Q02785 WWM1YFL010C 636 nt20.02■□□□□ 0.8
PDR12Q02785 SAH1YER043C 1350 nt20.02■□□□□ 0.79
PDR12Q02785 HOM6YJR139C 1080 nt19.99■□□□□ 0.79
PDR12Q02785 YOL037CYOL037C 354 nt19.97■□□□□ 0.79
PDR12Q02785 YGR021WYGR021W 873 nt19.94■□□□□ 0.78
PDR12Q02785 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt19.79■□□□□ 0.76
PDR12Q02785 IMT4tM(CAU)E 72 nt19.79■□□□□ 0.76
PDR12Q02785 IMT3tM(CAU)J3 72 nt19.79■□□□□ 0.76
PDR12Q02785 IMT1tM(CAU)O1 72 nt19.79■□□□□ 0.76
PDR12Q02785 IMT2tM(CAU)P 72 nt19.79■□□□□ 0.76
PDR12Q02785 YJR120WYJR120W 351 nt19.78■□□□□ 0.76
PDR12Q02785 YJR018WYJR018W 363 nt19.76■□□□□ 0.75
PDR12Q02785 RKM5YLR137W 1104 nt19.71■□□□□ 0.75
PDR12Q02785 PUT4YOR348C 1884 nt19.56■□□□□ 0.72
PDR12Q02785 PUN1YLR414C 792 nt19.56■□□□□ 0.72
PDR12Q02785 RPP2BYDR382W 333 nt19.55■□□□□ 0.72
PDR12Q02785 PUS2YGL063W 1113 nt19.53■□□□□ 0.72
PDR12Q02785 ARE1YCR048W 1833 nt19.53■□□□□ 0.72
PDR12Q02785 MOT3YMR070W 1473 nt19.5■□□□□ 0.71
PDR12Q02785 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt19.5■□□□□ 0.71
PDR12Q02785 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt19.5■□□□□ 0.71
PDR12Q02785 YLR281CYLR281C 468 nt19.35■□□□□ 0.69
PDR12Q02785 SSA3YBL075C 1950 nt19.3■□□□□ 0.68
PDR12Q02785 BSC6YOL137W 1494 nt19.29■□□□□ 0.68
PDR12Q02785 BDH2YAL061W 1254 nt19.29■□□□□ 0.68
PDR12Q02785 PTC2YER089C 1395 nt19.28■□□□□ 0.68
PDR12Q02785 WHI5YOR083W 888 nt19.26■□□□□ 0.67
PDR12Q02785 FMP45YDL222C 930 nt19.19■□□□□ 0.66
PDR12Q02785 YLR236CYLR236C 324 nt19.12■□□□□ 0.65
PDR12Q02785 POA1YBR022W 534 nt19.12■□□□□ 0.65
PDR12Q02785 BUD23YCR047C 828 nt19.1■□□□□ 0.65
PDR12Q02785 YBL100CYBL100C 315 nt19.01■□□□□ 0.63
PDR12Q02785 YPR011CYPR011C 981 nt19■□□□□ 0.63
PDR12Q02785 DSK2YMR276W 1122 nt18.98■□□□□ 0.63
PDR12Q02785 FPR4YLR449W 1179 nt18.97■□□□□ 0.63
PDR12Q02785 LSM3YLR438C-A 270 nt18.94■□□□□ 0.62
PDR12Q02785 FIS1YIL065C 468 nt18.91■□□□□ 0.62
PDR12Q02785 NAB2YGL122C 1578 nt18.83■□□□□ 0.6
PDR12Q02785 YCH1YGR203W 447 nt18.81■□□□□ 0.6
PDR12Q02785 PHO4YFR034C 939 nt18.77■□□□□ 0.6
PDR12Q02785 DAL1YIR027C 1383 nt18.77■□□□□ 0.6
PDR12Q02785 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt18.76■□□□□ 0.59
PDR12Q02785 INM2YDR287W 879 nt18.74■□□□□ 0.59
PDR12Q02785 LPX1YOR084W 1164 nt18.72■□□□□ 0.59
PDR12Q02785 TRM9YML014W 840 nt18.7■□□□□ 0.58
PDR12Q02785 FUN26YAL022C 1554 nt18.7■□□□□ 0.58
PDR12Q02785 MRPL8YJL063C 717 nt18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.8 ms