Protein–RNA interactions for Protein: Q3E809

YML054C-A, Uncharacterized protein YML054C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML054C-AQ3E809 NSR1YGR159C 1245 nt10.52□□□□□ -0.73
YML054C-AQ3E809 YML009W-BYML009W-B 477 nt10.3□□□□□ -0.76
YML054C-AQ3E809 NOP1YDL014W 984 nt10.11□□□□□ -0.79
YML054C-AQ3E809 MDJ1YFL016C 1536 nt9.35□□□□□ -0.91
YML054C-AQ3E809 YKL036CYKL036C 393 nt9.01□□□□□ -0.97
YML054C-AQ3E809 YJL027CYJL027C 417 nt8.79□□□□□ -1
YML054C-AQ3E809 SRX1YKL086W 384 nt8.71□□□□□ -1.02
YML054C-AQ3E809 Q0297Q0297 156 nt8.66□□□□□ -1.02
YML054C-AQ3E809 YCR051WYCR051W 669 nt8.23□□□□□ -1.09
YML054C-AQ3E809 YBR190WYBR190W 312 nt8.2□□□□□ -1.1
YML054C-AQ3E809 DBP2YNL112W 1641 nt8.13□□□□□ -1.11
YML054C-AQ3E809 RTC3YHR087W 336 nt7.99□□□□□ -1.13
YML054C-AQ3E809 SCS3YGL126W 1143 nt7.96□□□□□ -1.14
YML054C-AQ3E809 TRN1tP(UGG)A 72 nt7.95□□□□□ -1.14
YML054C-AQ3E809 SUF9tP(UGG)F 72 nt7.95□□□□□ -1.14
YML054C-AQ3E809 SUF8tP(UGG)H 72 nt7.95□□□□□ -1.14
YML054C-AQ3E809 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt7.95□□□□□ -1.14
YML054C-AQ3E809 SUF7tP(UGG)M 72 nt7.95□□□□□ -1.14
YML054C-AQ3E809 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt7.95□□□□□ -1.14
YML054C-AQ3E809 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt7.95□□□□□ -1.14
YML054C-AQ3E809 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt7.95□□□□□ -1.14
YML054C-AQ3E809 SUF11tP(UGG)O2 72 nt7.95□□□□□ -1.14
YML054C-AQ3E809 RVS167YDR388W 1449 nt7.92□□□□□ -1.14
YML054C-AQ3E809 RDN37-1RDN37-1 5354 nt7.84□□□□□ -1.15
YML054C-AQ3E809 RDN37-2RDN37-2 5354 nt7.84□□□□□ -1.15
YML054C-AQ3E809 CCC1YLR220W 969 nt7.84□□□□□ -1.15
YML054C-AQ3E809 YJL225CYJL225C 5277 nt7.79□□□□□ -1.16
YML054C-AQ3E809 RPP1BYDL130W 321 nt7.77□□□□□ -1.17
YML054C-AQ3E809 YOL085CYOL085C 342 nt7.72□□□□□ -1.17
YML054C-AQ3E809 PKP1YIL042C 1185 nt7.54□□□□□ -1.2
YML054C-AQ3E809 SCJ1YMR214W 1134 nt7.51□□□□□ -1.21
YML054C-AQ3E809 SHR5YOL110W 714 nt7.48□□□□□ -1.21
YML054C-AQ3E809 PUT4YOR348C 1884 nt7.45□□□□□ -1.22
YML054C-AQ3E809 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt7.45□□□□□ -1.22
YML054C-AQ3E809 SSA3YBL075C 1950 nt7.43□□□□□ -1.22
YML054C-AQ3E809 SCR1SCR1 522 nt7.42□□□□□ -1.22
YML054C-AQ3E809 RPN10YHR200W 807 nt7.4□□□□□ -1.22
YML054C-AQ3E809 URN1YPR152C 1398 nt7.34□□□□□ -1.23
YML054C-AQ3E809 PET122YER153C 765 nt7.34□□□□□ -1.23
YML054C-AQ3E809 OPI9YLR338W 858 nt7.32□□□□□ -1.24
YML054C-AQ3E809 YDJ1YNL064C 1230 nt7.3□□□□□ -1.24
YML054C-AQ3E809 ARE1YCR048W 1833 nt7.23□□□□□ -1.25
YML054C-AQ3E809 YNL208WYNL208W 600 nt7.23□□□□□ -1.25
YML054C-AQ3E809 SAH1YER043C 1350 nt7.22□□□□□ -1.25
YML054C-AQ3E809 POA1YBR022W 534 nt7.22□□□□□ -1.25
YML054C-AQ3E809 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt7.21□□□□□ -1.26
YML054C-AQ3E809 DEP1YAL013W 1218 nt7.19□□□□□ -1.26
YML054C-AQ3E809 PUN1YLR414C 792 nt7.19□□□□□ -1.26
YML054C-AQ3E809 RRN5YLR141W 1092 nt7.12□□□□□ -1.27
YML054C-AQ3E809 BSC6YOL137W 1494 nt7.11□□□□□ -1.27
YML054C-AQ3E809 ATS1YAL020C 1002 nt7.1□□□□□ -1.27
YML054C-AQ3E809 GAR1YHR089C 618 nt7.07□□□□□ -1.28
YML054C-AQ3E809 BUD23YCR047C 828 nt7.05□□□□□ -1.28
YML054C-AQ3E809 NAB2YGL122C 1578 nt7.03□□□□□ -1.28
YML054C-AQ3E809 YJR018WYJR018W 363 nt7.03□□□□□ -1.28
YML054C-AQ3E809 PTC2YER089C 1395 nt7.01□□□□□ -1.29
YML054C-AQ3E809 YER088W-BYER088W-B 147 nt6.98□□□□□ -1.29
YML054C-AQ3E809 RPP2BYDR382W 333 nt6.97□□□□□ -1.29
YML054C-AQ3E809 RSB1YOR049C 1065 nt6.97□□□□□ -1.29
YML054C-AQ3E809 INM2YDR287W 879 nt6.91□□□□□ -1.3
YML054C-AQ3E809 DAL1YIR027C 1383 nt6.88□□□□□ -1.31
YML054C-AQ3E809 TIR1YER011W 765 nt6.87□□□□□ -1.31
YML054C-AQ3E809 FPR4YLR449W 1179 nt6.83□□□□□ -1.32
YML054C-AQ3E809 SPT5YML010W 3192 nt6.78□□□□□ -1.32
YML054C-AQ3E809 FIS1YIL065C 468 nt6.77□□□□□ -1.33
YML054C-AQ3E809 PHO4YFR034C 939 nt6.76□□□□□ -1.33
YML054C-AQ3E809 SSA4YER103W 1929 nt6.76□□□□□ -1.33
YML054C-AQ3E809 MEP2YNL142W 1500 nt6.74□□□□□ -1.33
YML054C-AQ3E809 YMR090WYMR090W 684 nt6.72□□□□□ -1.33
YML054C-AQ3E809 YBL100CYBL100C 315 nt6.72□□□□□ -1.33
YML054C-AQ3E809 SSA1YAL005C 1929 nt6.72□□□□□ -1.33
YML054C-AQ3E809 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt6.7□□□□□ -1.34
YML054C-AQ3E809 YPS1YLR120C 1710 nt6.7□□□□□ -1.34
YML054C-AQ3E809 BDH2YAL061W 1254 nt6.69□□□□□ -1.34
YML054C-AQ3E809 ALF1YNL148C 765 nt6.67□□□□□ -1.34
YML054C-AQ3E809 YJR120WYJR120W 351 nt6.65□□□□□ -1.34
YML054C-AQ3E809 YDR095CYDR095C 411 nt6.64□□□□□ -1.35
YML054C-AQ3E809 TRM9YML014W 840 nt6.64□□□□□ -1.35
YML054C-AQ3E809 SUF2tP(AGG)C 72 nt6.63□□□□□ -1.35
YML054C-AQ3E809 SUF10tP(AGG)N 72 nt6.63□□□□□ -1.35
YML054C-AQ3E809 LSM3YLR438C-A 270 nt6.62□□□□□ -1.35
YML054C-AQ3E809 FUN26YAL022C 1554 nt6.6□□□□□ -1.35
YML054C-AQ3E809 PST2YDR032C 597 nt6.58□□□□□ -1.36
YML054C-AQ3E809 YGR021WYGR021W 873 nt6.57□□□□□ -1.36
YML054C-AQ3E809 RPP2AYOL039W 321 nt6.55□□□□□ -1.36
YML054C-AQ3E809 EMI2YDR516C 1503 nt6.53□□□□□ -1.36
YML054C-AQ3E809 CCT6YDR188W 1641 nt6.53□□□□□ -1.36
YML054C-AQ3E809 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt6.51□□□□□ -1.37
YML054C-AQ3E809 DCW1YKL046C 1350 nt6.49□□□□□ -1.37
YML054C-AQ3E809 YDL221WYDL221W 552 nt6.47□□□□□ -1.37
YML054C-AQ3E809 SIS1YNL007C 1059 nt6.46□□□□□ -1.38
YML054C-AQ3E809 WWM1YFL010C 636 nt6.44□□□□□ -1.38
YML054C-AQ3E809 YCH1YGR203W 447 nt6.44□□□□□ -1.38
YML054C-AQ3E809 BDF1YLR399C 2061 nt6.44□□□□□ -1.38
YML054C-AQ3E809 SEC11YIR022W 504 nt6.43□□□□□ -1.38
YML054C-AQ3E809 YBR220CYBR220C 1683 nt6.42□□□□□ -1.38
YML054C-AQ3E809 SDH1YKL148C 1923 nt6.42□□□□□ -1.38
YML054C-AQ3E809 TAT1YBR069C 1860 nt6.41□□□□□ -1.38
YML054C-AQ3E809 PTP1YDL230W 1008 nt6.38□□□□□ -1.39
YML054C-AQ3E809 PET9YBL030C 957 nt6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms