Protein–RNA interactions for Protein: Q12150

CSF1, Protein CSF1, yeastyeast

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Length 2,958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSF1Q12150 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.59■□□□□ 0.73
CSF1Q12150 NOP1YDL014W 984 nt18.78■□□□□ 0.6
CSF1Q12150 NSR1YGR159C 1245 nt18.63■□□□□ 0.57
CSF1Q12150 YKL036CYKL036C 393 nt18.17■□□□□ 0.5
CSF1Q12150 YJL027CYJL027C 417 nt16.99■□□□□ 0.31
CSF1Q12150 SRX1YKL086W 384 nt16.88■□□□□ 0.29
CSF1Q12150 SCS3YGL126W 1143 nt16.86■□□□□ 0.29
CSF1Q12150 Q0297Q0297 156 nt16.79■□□□□ 0.28
CSF1Q12150 MDJ1YFL016C 1536 nt16.36■□□□□ 0.21
CSF1Q12150 YCR051WYCR051W 669 nt15.93■□□□□ 0.14
CSF1Q12150 PKP1YIL042C 1185 nt15.69■□□□□ 0.1
CSF1Q12150 YOL085CYOL085C 342 nt15.59■□□□□ 0.09
CSF1Q12150 SCJ1YMR214W 1134 nt15.33■□□□□ 0.04
CSF1Q12150 ATS1YAL020C 1002 nt15.18■□□□□ 0.02
CSF1Q12150 RPP1BYDL130W 321 nt15.11■□□□□ 0.01
CSF1Q12150 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CSF1Q12150 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CSF1Q12150 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CSF1Q12150 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CSF1Q12150 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CSF1Q12150 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CSF1Q12150 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CSF1Q12150 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CSF1Q12150 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.88□□□□□ -0.03
CSF1Q12150 DBP2YNL112W 1641 nt14.87□□□□□ -0.03
CSF1Q12150 CCC1YLR220W 969 nt14.82□□□□□ -0.04
CSF1Q12150 PET122YER153C 765 nt14.56□□□□□ -0.08
CSF1Q12150 SCR1SCR1 522 nt14.42□□□□□ -0.1
CSF1Q12150 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.31□□□□□ -0.12
CSF1Q12150 RTC3YHR087W 336 nt14.28□□□□□ -0.12
CSF1Q12150 RRN5YLR141W 1092 nt14.13□□□□□ -0.15
CSF1Q12150 RSB1YOR049C 1065 nt14.09□□□□□ -0.15
CSF1Q12150 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.89□□□□□ -0.19
CSF1Q12150 PST2YDR032C 597 nt13.87□□□□□ -0.19
CSF1Q12150 RVS167YDR388W 1449 nt13.75□□□□□ -0.21
CSF1Q12150 YKL097CYKL097C 411 nt13.65□□□□□ -0.22
CSF1Q12150 SHR5YOL110W 714 nt13.58□□□□□ -0.24
CSF1Q12150 YBR190WYBR190W 312 nt13.52□□□□□ -0.25
CSF1Q12150 YDJ1YNL064C 1230 nt13.45□□□□□ -0.26
CSF1Q12150 GAR1YHR089C 618 nt13.42□□□□□ -0.26
CSF1Q12150 SHU1YHL006C 453 nt13.34□□□□□ -0.27
CSF1Q12150 YOR139CYOR139C 393 nt13.2□□□□□ -0.3
CSF1Q12150 DEP1YAL013W 1218 nt13.18□□□□□ -0.3
CSF1Q12150 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.18□□□□□ -0.3
CSF1Q12150 URN1YPR152C 1398 nt12.91□□□□□ -0.34
CSF1Q12150 NPL3YDR432W 1245 nt12.91□□□□□ -0.34
CSF1Q12150 TIR1YER011W 765 nt12.78□□□□□ -0.36
CSF1Q12150 SSA1YAL005C 1929 nt12.77□□□□□ -0.37
CSF1Q12150 YNL208WYNL208W 600 nt12.76□□□□□ -0.37
CSF1Q12150 MNP1YGL068W 585 nt12.71□□□□□ -0.37
CSF1Q12150 SRB2YHR041C 633 nt12.67□□□□□ -0.38
CSF1Q12150 HOM6YJR139C 1080 nt12.54□□□□□ -0.4
CSF1Q12150 SSA3YBL075C 1950 nt12.54□□□□□ -0.4
CSF1Q12150 WWM1YFL010C 636 nt12.52□□□□□ -0.41
CSF1Q12150 RPN10YHR200W 807 nt12.42□□□□□ -0.42
CSF1Q12150 YGR021WYGR021W 873 nt12.42□□□□□ -0.42
CSF1Q12150 ARE1YCR048W 1833 nt12.41□□□□□ -0.42
CSF1Q12150 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CSF1Q12150 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CSF1Q12150 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CSF1Q12150 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CSF1Q12150 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.41□□□□□ -0.42
CSF1Q12150 PUS2YGL063W 1113 nt12.39□□□□□ -0.43
CSF1Q12150 MOT3YMR070W 1473 nt12.38□□□□□ -0.43
CSF1Q12150 SAH1YER043C 1350 nt12.34□□□□□ -0.43
CSF1Q12150 YOL037CYOL037C 354 nt12.33□□□□□ -0.43
CSF1Q12150 OPI9YLR338W 858 nt12.33□□□□□ -0.44
CSF1Q12150 YLR281CYLR281C 468 nt12.28□□□□□ -0.44
CSF1Q12150 PUT4YOR348C 1884 nt12.19□□□□□ -0.46
CSF1Q12150 YJR120WYJR120W 351 nt12.16□□□□□ -0.46
CSF1Q12150 YJR018WYJR018W 363 nt12.13□□□□□ -0.47
CSF1Q12150 YPR011CYPR011C 981 nt12.13□□□□□ -0.47
CSF1Q12150 RPP2BYDR382W 333 nt12.12□□□□□ -0.47
CSF1Q12150 WHI5YOR083W 888 nt12.11□□□□□ -0.47
CSF1Q12150 YLR236CYLR236C 324 nt12.11□□□□□ -0.47
CSF1Q12150 RKM5YLR137W 1104 nt12.1□□□□□ -0.47
CSF1Q12150 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.09□□□□□ -0.47
CSF1Q12150 BSC6YOL137W 1494 nt12.06□□□□□ -0.48
CSF1Q12150 BDH2YAL061W 1254 nt12.03□□□□□ -0.48
CSF1Q12150 DSK2YMR276W 1122 nt12.03□□□□□ -0.48
CSF1Q12150 POA1YBR022W 534 nt11.97□□□□□ -0.49
CSF1Q12150 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.93□□□□□ -0.5
CSF1Q12150 FMP45YDL222C 930 nt11.92□□□□□ -0.5
CSF1Q12150 PTC2YER089C 1395 nt11.91□□□□□ -0.5
CSF1Q12150 MRPL8YJL063C 717 nt11.91□□□□□ -0.5
CSF1Q12150 PUN1YLR414C 792 nt11.91□□□□□ -0.5
CSF1Q12150 UBX6YJL048C 1191 nt11.85□□□□□ -0.51
CSF1Q12150 LPX1YOR084W 1164 nt11.83□□□□□ -0.52
CSF1Q12150 YBL100CYBL100C 315 nt11.81□□□□□ -0.52
CSF1Q12150 SPP1YPL138C 1062 nt11.81□□□□□ -0.52
CSF1Q12150 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.79□□□□□ -0.52
CSF1Q12150 YEL076CYEL076C 651 nt11.79□□□□□ -0.52
CSF1Q12150 YLR464WYLR464W 651 nt11.79□□□□□ -0.52
CSF1Q12150 LSM3YLR438C-A 270 nt11.75□□□□□ -0.53
CSF1Q12150 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.74□□□□□ -0.53
CSF1Q12150 NAB2YGL122C 1578 nt11.71□□□□□ -0.54
CSF1Q12150 YCH1YGR203W 447 nt11.7□□□□□ -0.54
CSF1Q12150 FIS1YIL065C 468 nt11.7□□□□□ -0.54
CSF1Q12150 RTG1YOL067C 534 nt11.68□□□□□ -0.54
CSF1Q12150 BUD23YCR047C 828 nt11.67□□□□□ -0.54
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