Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 YML009W-BYML009W-B 477 nt29.24■■■□□ 2.27
PDR11P40550 NSR1YGR159C 1245 nt28.35■■■□□ 2.13
PDR11P40550 NOP1YDL014W 984 nt28.23■■■□□ 2.11
PDR11P40550 YKL036CYKL036C 393 nt26.65■■□□□ 1.86
PDR11P40550 MDJ1YFL016C 1536 nt25.19■■□□□ 1.62
PDR11P40550 YJL027CYJL027C 417 nt25.01■■□□□ 1.59
PDR11P40550 Q0297Q0297 156 nt24.97■■□□□ 1.59
PDR11P40550 SRX1YKL086W 384 nt24.83■■□□□ 1.57
PDR11P40550 SCS3YGL126W 1143 nt24.65■■□□□ 1.54
PDR11P40550 YCR051WYCR051W 669 nt23.71■■□□□ 1.39
PDR11P40550 YOL085CYOL085C 342 nt23.12■■□□□ 1.29
PDR11P40550 PKP1YIL042C 1185 nt22.95■■□□□ 1.26
PDR11P40550 RPP1BYDL130W 321 nt22.44■■□□□ 1.18
PDR11P40550 DBP2YNL112W 1641 nt22.4■■□□□ 1.18
PDR11P40550 TRN1tP(UGG)A 72 nt22.3■■□□□ 1.16
PDR11P40550 SUF9tP(UGG)F 72 nt22.3■■□□□ 1.16
PDR11P40550 SUF8tP(UGG)H 72 nt22.3■■□□□ 1.16
PDR11P40550 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt22.3■■□□□ 1.16
PDR11P40550 SUF7tP(UGG)M 72 nt22.3■■□□□ 1.16
PDR11P40550 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt22.3■■□□□ 1.16
PDR11P40550 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt22.3■■□□□ 1.16
PDR11P40550 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt22.3■■□□□ 1.16
PDR11P40550 SUF11tP(UGG)O2 72 nt22.3■■□□□ 1.16
PDR11P40550 SCJ1YMR214W 1134 nt22.17■■□□□ 1.14
PDR11P40550 CCC1YLR220W 969 nt22.16■■□□□ 1.14
PDR11P40550 ATS1YAL020C 1002 nt22.05■■□□□ 1.12
PDR11P40550 PET122YER153C 765 nt21.6■■□□□ 1.05
PDR11P40550 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt21.21■□□□□ 0.99
PDR11P40550 SCR1SCR1 522 nt21.2■□□□□ 0.98
PDR11P40550 YBR190WYBR190W 312 nt21.02■□□□□ 0.96
PDR11P40550 RRN5YLR141W 1092 nt20.92■□□□□ 0.94
PDR11P40550 RVS167YDR388W 1449 nt20.86■□□□□ 0.93
PDR11P40550 RTC3YHR087W 336 nt20.7■□□□□ 0.9
PDR11P40550 RSB1YOR049C 1065 nt20.65■□□□□ 0.9
PDR11P40550 YER088W-BYER088W-B 147 nt20.52■□□□□ 0.87
PDR11P40550 YDJ1YNL064C 1230 nt20.36■□□□□ 0.85
PDR11P40550 SHR5YOL110W 714 nt20.34■□□□□ 0.85
PDR11P40550 PST2YDR032C 597 nt20.33■□□□□ 0.84
PDR11P40550 GAR1YHR089C 618 nt20.06■□□□□ 0.8
PDR11P40550 DEP1YAL013W 1218 nt19.89■□□□□ 0.77
PDR11P40550 YKL097CYKL097C 411 nt19.77■□□□□ 0.76
PDR11P40550 URN1YPR152C 1398 nt19.61■□□□□ 0.73
PDR11P40550 SHU1YHL006C 453 nt19.56■□□□□ 0.72
PDR11P40550 YNL208WYNL208W 600 nt19.31■□□□□ 0.68
PDR11P40550 TIR1YER011W 765 nt19.29■□□□□ 0.68
PDR11P40550 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt19.25■□□□□ 0.67
PDR11P40550 RPN10YHR200W 807 nt19.17■□□□□ 0.66
PDR11P40550 SRB2YHR041C 633 nt19.12■□□□□ 0.65
PDR11P40550 OPI9YLR338W 858 nt19.11■□□□□ 0.65
PDR11P40550 SSA1YAL005C 1929 nt19.09■□□□□ 0.65
PDR11P40550 YOR139CYOR139C 393 nt19.08■□□□□ 0.64
PDR11P40550 SAH1YER043C 1350 nt19.06■□□□□ 0.64
PDR11P40550 PUT4YOR348C 1884 nt18.92■□□□□ 0.62
PDR11P40550 ARE1YCR048W 1833 nt18.77■□□□□ 0.59
PDR11P40550 MNP1YGL068W 585 nt18.76■□□□□ 0.59
PDR11P40550 YJR120WYJR120W 351 nt18.73■□□□□ 0.59
PDR11P40550 WWM1YFL010C 636 nt18.66■□□□□ 0.58
PDR11P40550 YJR018WYJR018W 363 nt18.66■□□□□ 0.58
PDR11P40550 NPL3YDR432W 1245 nt18.64■□□□□ 0.57
PDR11P40550 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt18.58■□□□□ 0.57
PDR11P40550 HOM6YJR139C 1080 nt18.55■□□□□ 0.56
PDR11P40550 PUN1YLR414C 792 nt18.49■□□□□ 0.55
PDR11P40550 YGR021WYGR021W 873 nt18.4■□□□□ 0.54
PDR11P40550 POA1YBR022W 534 nt18.4■□□□□ 0.54
PDR11P40550 PTC2YER089C 1395 nt18.34■□□□□ 0.53
PDR11P40550 SSA3YBL075C 1950 nt18.3■□□□□ 0.52
PDR11P40550 RPP2BYDR382W 333 nt18.26■□□□□ 0.51
PDR11P40550 RKM5YLR137W 1104 nt18.26■□□□□ 0.51
PDR11P40550 YOL037CYOL037C 354 nt18.26■□□□□ 0.51
PDR11P40550 BUD23YCR047C 828 nt18.16■□□□□ 0.5
PDR11P40550 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt18.16■□□□□ 0.5
PDR11P40550 IMT4tM(CAU)E 72 nt18.16■□□□□ 0.5
PDR11P40550 IMT3tM(CAU)J3 72 nt18.16■□□□□ 0.5
PDR11P40550 IMT1tM(CAU)O1 72 nt18.16■□□□□ 0.5
PDR11P40550 IMT2tM(CAU)P 72 nt18.16■□□□□ 0.5
PDR11P40550 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt18.12■□□□□ 0.49
PDR11P40550 BDH2YAL061W 1254 nt18.06■□□□□ 0.48
PDR11P40550 FIS1YIL065C 468 nt17.97■□□□□ 0.47
PDR11P40550 BSC6YOL137W 1494 nt17.94■□□□□ 0.46
PDR11P40550 FPR4YLR449W 1179 nt17.92■□□□□ 0.46
PDR11P40550 PUS2YGL063W 1113 nt17.91■□□□□ 0.46
PDR11P40550 NAB2YGL122C 1578 nt17.91■□□□□ 0.46
PDR11P40550 YBL100CYBL100C 315 nt17.88■□□□□ 0.45
PDR11P40550 YLR281CYLR281C 468 nt17.86■□□□□ 0.45
PDR11P40550 DAL1YIR027C 1383 nt17.8■□□□□ 0.44
PDR11P40550 WHI5YOR083W 888 nt17.8■□□□□ 0.44
PDR11P40550 PHO4YFR034C 939 nt17.77■□□□□ 0.44
PDR11P40550 LSM3YLR438C-A 270 nt17.75■□□□□ 0.43
PDR11P40550 INM2YDR287W 879 nt17.73■□□□□ 0.43
PDR11P40550 YPR011CYPR011C 981 nt17.69■□□□□ 0.42
PDR11P40550 MOT3YMR070W 1473 nt17.69■□□□□ 0.42
PDR11P40550 YLR236CYLR236C 324 nt17.66■□□□□ 0.42
PDR11P40550 FUN26YAL022C 1554 nt17.66■□□□□ 0.42
PDR11P40550 TRM9YML014W 840 nt17.58■□□□□ 0.41
PDR11P40550 FMP45YDL222C 930 nt17.55■□□□□ 0.4
PDR11P40550 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt17.45■□□□□ 0.38
PDR11P40550 DSK2YMR276W 1122 nt17.45■□□□□ 0.38
PDR11P40550 CCT6YDR188W 1641 nt17.42■□□□□ 0.38
PDR11P40550 LPX1YOR084W 1164 nt17.29■□□□□ 0.36
PDR11P40550 YJL152WYJL152W 360 nt17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.8 ms