Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q546

HUB1, Ubiquitin-like modifier HUB1, yeastyeast

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HUB1Q6Q546 NSR1YGR159C 1245 nt10.77□□□□□ -0.69
HUB1Q6Q546 MDJ1YFL016C 1536 nt10.15□□□□□ -0.78
HUB1Q6Q546 YML009W-BYML009W-B 477 nt10.14□□□□□ -0.79
HUB1Q6Q546 SSA3YBL075C 1950 nt10.1□□□□□ -0.79
HUB1Q6Q546 NOP1YDL014W 984 nt9.7□□□□□ -0.86
HUB1Q6Q546 YJL027CYJL027C 417 nt9.43□□□□□ -0.9
HUB1Q6Q546 YBR190WYBR190W 312 nt9.02□□□□□ -0.97
HUB1Q6Q546 YJL225CYJL225C 5277 nt8.82□□□□□ -1
HUB1Q6Q546 RTC3YHR087W 336 nt8.75□□□□□ -1.01
HUB1Q6Q546 RDN37-1RDN37-1 5354 nt8.73□□□□□ -1.01
HUB1Q6Q546 RDN37-2RDN37-2 5354 nt8.73□□□□□ -1.01
HUB1Q6Q546 PUT4YOR348C 1884 nt8.68□□□□□ -1.02
HUB1Q6Q546 SSA4YER103W 1929 nt8.65□□□□□ -1.02
HUB1Q6Q546 DBP2YNL112W 1641 nt8.65□□□□□ -1.03
HUB1Q6Q546 PAC11YDR488C 1602 nt8.58□□□□□ -1.04
HUB1Q6Q546 SPT5YML010W 3192 nt8.46□□□□□ -1.05
HUB1Q6Q546 SRX1YKL086W 384 nt8.43□□□□□ -1.06
HUB1Q6Q546 NVJ2YPR091C 2313 nt8.39□□□□□ -1.07
HUB1Q6Q546 BDF1YLR399C 2061 nt8.37□□□□□ -1.07
HUB1Q6Q546 POA1YBR022W 534 nt8.34□□□□□ -1.07
HUB1Q6Q546 BSC6YOL137W 1494 nt8.32□□□□□ -1.08
HUB1Q6Q546 TAT1YBR069C 1860 nt8.28□□□□□ -1.08
HUB1Q6Q546 ARE1YCR048W 1833 nt8.26□□□□□ -1.09
HUB1Q6Q546 Q0297Q0297 156 nt8.25□□□□□ -1.09
HUB1Q6Q546 YKL036CYKL036C 393 nt8.25□□□□□ -1.09
HUB1Q6Q546 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt8.2□□□□□ -1.1
HUB1Q6Q546 RVS167YDR388W 1449 nt8.19□□□□□ -1.1
HUB1Q6Q546 FPS1YLL043W 2010 nt8.07□□□□□ -1.12
HUB1Q6Q546 TRN1tP(UGG)A 72 nt8.02□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 SUF9tP(UGG)F 72 nt8.02□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 SUF8tP(UGG)H 72 nt8.02□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt8.02□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 SUF7tP(UGG)M 72 nt8.02□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt8.02□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt8.02□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt8.02□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 SUF11tP(UGG)O2 72 nt8.02□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 URN1YPR152C 1398 nt8.01□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 SCJ1YMR214W 1134 nt8.01□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 SAH1YER043C 1350 nt8□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 BUD23YCR047C 828 nt7.97□□□□□ -1.13
HUB1Q6Q546 MEP2YNL142W 1500 nt7.94□□□□□ -1.14
HUB1Q6Q546 OPI9YLR338W 858 nt7.94□□□□□ -1.14
HUB1Q6Q546 YCR051WYCR051W 669 nt7.85□□□□□ -1.15
HUB1Q6Q546 YMR090WYMR090W 684 nt7.85□□□□□ -1.15
HUB1Q6Q546 CCC1YLR220W 969 nt7.8□□□□□ -1.16
HUB1Q6Q546 NAB2YGL122C 1578 nt7.8□□□□□ -1.16
HUB1Q6Q546 SEC11YIR022W 504 nt7.77□□□□□ -1.17
HUB1Q6Q546 PUN1YLR414C 792 nt7.77□□□□□ -1.17
HUB1Q6Q546 YBR220CYBR220C 1683 nt7.76□□□□□ -1.17
HUB1Q6Q546 PCH2YBR186W 1695 nt7.75□□□□□ -1.17
HUB1Q6Q546 RPN10YHR200W 807 nt7.73□□□□□ -1.17
HUB1Q6Q546 SSA1YAL005C 1929 nt7.72□□□□□ -1.17
HUB1Q6Q546 GUT2YIL155C 1950 nt7.71□□□□□ -1.18
HUB1Q6Q546 PTC2YER089C 1395 nt7.71□□□□□ -1.18
HUB1Q6Q546 UME6YDR207C 2511 nt7.69□□□□□ -1.18
HUB1Q6Q546 DCW1YKL046C 1350 nt7.68□□□□□ -1.18
HUB1Q6Q546 BOR1YNL275W 1731 nt7.67□□□□□ -1.18
HUB1Q6Q546 EMI2YDR516C 1503 nt7.65□□□□□ -1.18
HUB1Q6Q546 SHR5YOL110W 714 nt7.64□□□□□ -1.19
HUB1Q6Q546 SDH1YKL148C 1923 nt7.6□□□□□ -1.19
HUB1Q6Q546 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt7.55□□□□□ -1.2
HUB1Q6Q546 DEP1YAL013W 1218 nt7.55□□□□□ -1.2
HUB1Q6Q546 YPS1YLR120C 1710 nt7.55□□□□□ -1.2
HUB1Q6Q546 YDL221WYDL221W 552 nt7.54□□□□□ -1.2
HUB1Q6Q546 DAL1YIR027C 1383 nt7.52□□□□□ -1.21
HUB1Q6Q546 YOL085CYOL085C 342 nt7.5□□□□□ -1.21
HUB1Q6Q546 FIS1YIL065C 468 nt7.49□□□□□ -1.21
HUB1Q6Q546 YNL208WYNL208W 600 nt7.49□□□□□ -1.21
HUB1Q6Q546 RTF1YGL244W 1677 nt7.47□□□□□ -1.21
HUB1Q6Q546 YJR018WYJR018W 363 nt7.47□□□□□ -1.21
HUB1Q6Q546 PIB2YGL023C 1908 nt7.45□□□□□ -1.22
HUB1Q6Q546 FPR4YLR449W 1179 nt7.44□□□□□ -1.22
HUB1Q6Q546 SCC4YER147C 1875 nt7.43□□□□□ -1.22
HUB1Q6Q546 PHO4YFR034C 939 nt7.4□□□□□ -1.22
HUB1Q6Q546 BOP3YNL042W 1191 nt7.4□□□□□ -1.22
HUB1Q6Q546 MCH5YOR306C 1566 nt7.39□□□□□ -1.23
HUB1Q6Q546 INM2YDR287W 879 nt7.39□□□□□ -1.23
HUB1Q6Q546 RPP1BYDL130W 321 nt7.37□□□□□ -1.23
HUB1Q6Q546 YDR095CYDR095C 411 nt7.37□□□□□ -1.23
HUB1Q6Q546 ALG12YNR030W 1656 nt7.32□□□□□ -1.24
HUB1Q6Q546 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt7.32□□□□□ -1.24
HUB1Q6Q546 YSC84YHR016C 1407 nt7.32□□□□□ -1.24
HUB1Q6Q546 PTK1YKL198C 1989 nt7.28□□□□□ -1.24
HUB1Q6Q546 RPP2AYOL039W 321 nt7.26□□□□□ -1.25
HUB1Q6Q546 CAC2YML102W 1407 nt7.26□□□□□ -1.25
HUB1Q6Q546 RPP2BYDR382W 333 nt7.22□□□□□ -1.25
HUB1Q6Q546 YHL050CYHL050C 2094 nt7.2□□□□□ -1.26
HUB1Q6Q546 HSP60YLR259C 1719 nt7.18□□□□□ -1.26
HUB1Q6Q546 PTP1YDL230W 1008 nt7.18□□□□□ -1.26
HUB1Q6Q546 YNL195CYNL195C 786 nt7.18□□□□□ -1.26
HUB1Q6Q546 GIS3YLR094C 1509 nt7.17□□□□□ -1.26
HUB1Q6Q546 IRC15YPL017C 1500 nt7.17□□□□□ -1.26
HUB1Q6Q546 YDJ1YNL064C 1230 nt7.17□□□□□ -1.26
HUB1Q6Q546 YFL054CYFL054C 1941 nt7.17□□□□□ -1.26
HUB1Q6Q546 SPT8YLR055C 1809 nt7.15□□□□□ -1.26
HUB1Q6Q546 DSK2YMR276W 1122 nt7.13□□□□□ -1.27
HUB1Q6Q546 ALF1YNL148C 765 nt7.13□□□□□ -1.27
HUB1Q6Q546 YBL100CYBL100C 315 nt7.12□□□□□ -1.27
HUB1Q6Q546 SCS3YGL126W 1143 nt7.1□□□□□ -1.27
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