RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A RPA190P10964 1664 aaKnown RBP-2.98□□□□□ -2.89
YMR001C-AYMR001C-A TSC11P40061 1430 aa-2.98□□□□□ -2.89
YMR001C-AYMR001C-A NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP-2.98□□□□□ -2.89
YMR001C-AYMR001C-A MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
YMR001C-AYMR001C-A SMC4Q12267 1418 aa-3□□□□□ -2.89
YMR001C-AYMR001C-A SUS1Q6WNK7 96 aa-3□□□□□ -2.89
YMR001C-AYMR001C-A UTP10P42945 1769 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
YMR001C-AYMR001C-A RPS12P48589 143 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
YMR001C-AYMR001C-A RPO21P04050 1733 aaKnown RBP-3.02□□□□□ -2.89
YMR001C-AYMR001C-A APC1P53886 1748 aa-3.02□□□□□ -2.89
YMR001C-AYMR001C-A IRC20Q06554 1556 aa-3.04□□□□□ -2.9
YMR001C-AYMR001C-A MSL1P40567 111 aaPredicted RBP-3.05□□□□□ -2.9
YMR001C-AYMR001C-A YDR042CQ03205 200 aa-3.06□□□□□ -2.9
YMR001C-AYMR001C-A SCP1Q08873 200 aa-3.07□□□□□ -2.9
YMR001C-AYMR001C-A YOR343CQ12484 108 aa-3.08□□□□□ -2.9
YMR001C-AYMR001C-A GDB1Q06625 1536 aa-3.09□□□□□ -2.9
YMR001C-AYMR001C-A YIL156W-BQ2V2P4 73 aa-3.11□□□□□ -2.91
YMR001C-AYMR001C-A YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa-3.12□□□□□ -2.91
YMR001C-AYMR001C-A COA2Q3E823 68 aa-3.13□□□□□ -2.91
YMR001C-AYMR001C-A YDR524C-BQ3E6R4 66 aa-3.14□□□□□ -2.91
YMR001C-AYMR001C-A YLR146W-AQ2V2P1 62 aa-3.16□□□□□ -2.92
YMR001C-AYMR001C-A KOG1P38873 1557 aa-3.17□□□□□ -2.92
YMR001C-AYMR001C-A YBR200W-AQ3E755 54 aa-3.19□□□□□ -2.92
YMR001C-AYMR001C-A TY3B-GQ99315 1547 aa-3.2□□□□□ -2.92
YMR001C-AYMR001C-A YOR105WQ08504 108 aa-3.21□□□□□ -2.92
YMR001C-AYMR001C-A SWR1Q05471 1514 aa-3.21□□□□□ -2.92
YMR001C-AYMR001C-A YOR011W-AQ3E807 68 aa-3.22□□□□□ -2.92
YMR001C-AYMR001C-A YER137CP40083 148 aaKnown RBP-3.24□□□□□ -2.93
YMR001C-AYMR001C-A YDL022C-AP0C5L6 82 aa-3.25□□□□□ -2.93
YMR001C-AYMR001C-A YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
YMR001C-AYMR001C-A YKL065W-AQ2V2P2 73 aa-3.27□□□□□ -2.93
YMR001C-AYMR001C-A YDR119W-AQ2V2P9 66 aa-3.27□□□□□ -2.93
YMR001C-AYMR001C-A YLL006W-AQ3E814 58 aa-3.27□□□□□ -2.93
YMR001C-AYMR001C-A ATP17Q06405 101 aa-3.29□□□□□ -2.94
YMR001C-AYMR001C-A YGL258W-AQ3E740 77 aa-3.31□□□□□ -2.94
YMR001C-AYMR001C-A MDS3P53094 1487 aa-3.32□□□□□ -2.94
YMR001C-AYMR001C-A YOR314WQ12506 109 aa-3.33□□□□□ -2.94
YMR001C-AYMR001C-A YBL039W-BP0C268 59 aa-3.35□□□□□ -2.95
YMR001C-AYMR001C-A YMR175W-AQ3E766 64 aa-3.37□□□□□ -2.95
YMR001C-AYMR001C-A RPS27BP38711 82 aa-3.41□□□□□ -2.96
YMR001C-AYMR001C-A YCL001W-BQ96VH2 84 aa-3.41□□□□□ -2.96
YMR001C-AYMR001C-A HAP1P0CE41 1502 aa-3.41□□□□□ -2.96
YMR001C-AYMR001C-A PDR10P51533 1564 aa-3.42□□□□□ -2.96
YMR001C-AYMR001C-A SIN3P22579 1536 aa-3.42□□□□□ -2.96
YMR001C-AYMR001C-A VPS15P22219 1454 aa-3.44□□□□□ -2.96
YMR001C-AYMR001C-A YMR082CQ04276 118 aa-3.46□□□□□ -2.96
YMR001C-AYMR001C-A YGR146C-AQ8TGT9 53 aa-3.46□□□□□ -2.96
YMR001C-AYMR001C-A YOR072W-BQ3E832 53 aa-3.5□□□□□ -2.97
YMR001C-AYMR001C-A QCR9P22289 66 aa-3.54□□□□□ -2.98
YMR001C-AYMR001C-A YPR145C-AQ2V2P0 78 aa-3.57□□□□□ -2.98
YMR001C-AYMR001C-A YBR230W-AQ3E762 66 aa-3.57□□□□□ -2.98
YMR001C-AYMR001C-A YGR121W-AQ3E816 71 aa-3.57□□□□□ -2.98
YMR001C-AYMR001C-A YOR032W-AQ8TGS1 66 aa-3.58□□□□□ -2.98
YMR001C-AYMR001C-A YGR035W-AQ45U48 73 aa-3.6□□□□□ -2.99
YMR001C-AYMR001C-A MMS22Q06164 1454 aa-3.6□□□□□ -2.99
YMR001C-AYMR001C-A SWM2P40342 146 aa-3.61□□□□□ -2.99
YMR001C-AYMR001C-A ZEO1Q08245 113 aa-3.61□□□□□ -2.99
YMR001C-AYMR001C-A PAU7P39545 55 aa-3.64□□□□□ -2.99
YMR001C-AYMR001C-A YCR075W-AQ3E830 75 aa-3.66□□□□□ -3
YMR001C-AYMR001C-A HUB1Q6Q546 73 aa-3.66□□□□□ -3
YMR001C-AYMR001C-A FKS3Q04952 1785 aa-3.66□□□□□ -3
YMR001C-AYMR001C-A YSP2Q06681 1438 aa-3.68□□□□□ -3
YMR001C-AYMR001C-A SSS1P35179 80 aa-3.7□□□□□ -3
YMR001C-AYMR001C-A FIG2P25653 1609 aa-3.71□□□□□ -3
YMR001C-AYMR001C-A YGL194C-AQ2V2P6 80 aa-3.73□□□□□ -3.01
YMR001C-AYMR001C-A MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP-3.73□□□□□ -3.01
YMR001C-AYMR001C-A LTE1P07866 1435 aa-3.76□□□□□ -3.01
YMR001C-AYMR001C-A Q0017Q9ZZX8 53 aa-3.76□□□□□ -3.01
YMR001C-AYMR001C-A CUP1-1P0CX80 61 aa-3.78□□□□□ -3.01
YMR001C-AYMR001C-A CUP1-2P0CX81 61 aa-3.78□□□□□ -3.01
YMR001C-AYMR001C-A SPI1P40092 148 aa-3.78□□□□□ -3.01
YMR001C-AYMR001C-A CWP2P43497 92 aa-3.79□□□□□ -3.02
YMR001C-AYMR001C-A DNF1P32660 1571 aa-3.85□□□□□ -3.02
YMR001C-AYMR001C-A YOR192C-CQ3E736 78 aa-3.86□□□□□ -3.03
YMR001C-AYMR001C-A ESP1Q03018 1630 aa-3.88□□□□□ -3.03
YMR001C-AYMR001C-A TIM12P32830 109 aa-3.9□□□□□ -3.03
YMR001C-AYMR001C-A ARO1P08566 1588 aaKnown RBP-3.9□□□□□ -3.03
YMR001C-AYMR001C-A PDR12Q02785 1511 aa-3.93□□□□□ -3.04
YMR001C-AYMR001C-A THO2P53552 1597 aaKnown RBP-3.93□□□□□ -3.04
YMR001C-AYMR001C-A ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP-3.99□□□□□ -3.05
YMR001C-AYMR001C-A ERI1P62651 68 aaKnown RBP-3.99□□□□□ -3.05
YMR001C-AYMR001C-A CSF1Q12150 2958 aa-3.99□□□□□ -3.05
YMR001C-AYMR001C-A RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP-4.03□□□□□ -3.05
YMR001C-AYMR001C-A RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP-4.03□□□□□ -3.05
YMR001C-AYMR001C-A YLR157W-DP0CE99 70 aa-4.04□□□□□ -3.06
YMR001C-AYMR001C-A SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP-4.05□□□□□ -3.06
YMR001C-AYMR001C-A DNF2Q12675 1612 aa-4.06□□□□□ -3.06
YMR001C-AYMR001C-A YML054C-AQ3E809 52 aa-4.07□□□□□ -3.06
YMR001C-AYMR001C-A IQG1Q12280 1495 aa-4.07□□□□□ -3.06
YMR001C-AYMR001C-A RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP-4.09□□□□□ -3.06
YMR001C-AYMR001C-A IML1P47170 1584 aa-4.1□□□□□ -3.07
YMR001C-AYMR001C-A PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP-4.11□□□□□ -3.07
YMR001C-AYMR001C-A BCK1Q01389 1478 aa-4.11□□□□□ -3.07
YMR001C-AYMR001C-A TY1B-DR4Q07793 1604 aa-4.12□□□□□ -3.07
YMR001C-AYMR001C-A YOL131WQ08270 108 aa-4.17□□□□□ -3.08
YMR001C-AYMR001C-A YOR093CQ12275 1648 aa-4.18□□□□□ -3.08
YMR001C-AYMR001C-A UFD4P33202 1483 aa-4.19□□□□□ -3.08
YMR001C-AYMR001C-A TRA1P38811 3744 aa-4.24□□□□□ -3.09
YMR001C-AYMR001C-A YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa-4.25□□□□□ -3.09
YMR001C-AYMR001C-A VMR1P38735 1592 aa-4.27□□□□□ -3.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.7 ms